58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1768 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1768  germination protein, Ger(x)C family  100 
 
 
361 aa  748    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0893  germination protein, Ger(x)C family  80.18 
 
 
481 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0642  spore germination B3 GerAC family protein  34.52 
 
 
360 aa  222  6e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0676  spore germination B3 GerAC family protein  32.11 
 
 
360 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0676  spore germination protein (GerAC)  31.75 
 
 
360 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0925  spore germination protein AC  32.18 
 
 
360 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0818  spore germination protein, GerC family  32.18 
 
 
361 aa  209  6e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0664  spore germination protein AC  31.2 
 
 
360 aa  209  8e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4516  GerAC  31.44 
 
 
360 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647016 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0762  spore germination protein GerYC  32.84 
 
 
331 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0726  spore germination protein GerYC  32.84 
 
 
331 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3119  spore germination protein, GerC family  28.02 
 
 
359 aa  176  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2886  GerC family spore germination protein  28.02 
 
 
359 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0825942  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3140  spore germination protein, GerC family  28.02 
 
 
359 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2118  spore germination protein, GerC family  28.02 
 
 
359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0833  spore germination protein GerYC  32.85 
 
 
270 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9712e-56 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4485  spore germination protein  26.65 
 
 
361 aa  159  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4846  spore germination protein GerHC  26.37 
 
 
359 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.504224  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4876  spore germination protein GerHC  26.65 
 
 
361 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4466  spore germination protein  26.07 
 
 
361 aa  155  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4632  spore germination protein GerHC  25.78 
 
 
359 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.589886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4854  spore germination protein GerHC  25.78 
 
 
359 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4986  spore germination protein GerHC  25.78 
 
 
359 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4871  spore germination protein GerHC  25.78 
 
 
361 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0390  spore germination protein GerHC  24.93 
 
 
359 aa  142  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3410  spore germination B3 GerAC family protein  24.65 
 
 
359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4565  spore germination B3 GerAC family protein  24.93 
 
 
359 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0150  spore germination protein C  25.41 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0234  spore germination protein, Ger  22.55 
 
 
376 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0201  spore germination protein C  22.32 
 
 
360 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2666  spore germination B3 GerAC family protein  23.69 
 
 
373 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00120  spore germination B3 GerAC family protein  21.45 
 
 
391 aa  81.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0701  spore germination protein GerKC  23.69 
 
 
374 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0669  spore germination protein GerKC  23.48 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0544  spore germination protein KC  23.76 
 
 
374 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0544  spore germination protein  23.76 
 
 
374 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.157397  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0633  spore germination protein GerKC  23.76 
 
 
374 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0600  spore germination protein GerKC  23.76 
 
 
374 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2465  germination protein, Ger(x)C family  22 
 
 
401 aa  69.7  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0762  spore germination protein GerKC  24.89 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0605  spore germination B3 GerAC family protein  18.95 
 
 
383 aa  67  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0845  germination protein, Ger(x)C family  17.84 
 
 
389 aa  66.2  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0546  spore germination B3 GerAC family protein  22.93 
 
 
374 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0053  spore germination B3 GerAC family protein  20.16 
 
 
402 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4668  spore germination protein GerKC  22.68 
 
 
374 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.310599999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0523  germination protein, Ger(x)C family  20.69 
 
 
399 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103906  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2458  germination protein, Ger(x)C family  19.55 
 
 
387 aa  57.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3281  germination protein, Ger(x)C family  19.61 
 
 
392 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000713918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1707  GerZC  17.86 
 
 
375 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000190927 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2437  germination protein, Ger(x)C family  21.96 
 
 
399 aa  54.7  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2064  spore germination B3 GerAC like  20.42 
 
 
423 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0147375  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2165  germination protein, Ger(x)C family  21 
 
 
397 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.370833  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1193  hypothetical protein  21.1 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2339  spore germination B3 GerAC family protein  16.67 
 
 
375 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00709674  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0298  germination protein, Ger(x)C family  18.78 
 
 
407 aa  46.6  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0077  hypothetical protein  23.44 
 
 
381 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0584  germination protein, Ger(x)C family  19.88 
 
 
407 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4592  spore germination protein GerLC  19.26 
 
 
380 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>