94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3515 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3515  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  100 
 
 		 307 aa  624  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0648  formate dehydrogenase accessory protein  43.69 
 
 		 321 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244649 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0557  formate dehydrogenase accessory protein  43.12 
 
 		 325 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0503  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  41.25 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1568  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  33.89 
 
 		 311 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_174  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase accessory protein  25.42 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105783  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0167  hypothetical protein  24.07 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000455155  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0038  protein involved in formate dehydrogenase formation  26.73 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000731666  normal  0.296733 
 
 
-
 
NC_002936  DET0185  formate dehydrogenase accessory protein FdhE, putative  25.42 
 
 		 282 aa  101  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1572  uncharacterized protein involved in formate dehydrogenase formation-like protein  37.6 
 
 		 280 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2641  formate dehydrogenase accessory protein  37.6 
 
 		 280 aa  90.9  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0951215 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1197  formate dehydrogenase accessory protein  33.99 
 
 		 265 aa  89.4  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0279  formate dehydrogenase accessory protein  25.98 
 
 		 294 aa  86.3  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0706  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  28.57 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1332  uncharacterized protein involved in formate dehydrogenase formation  25.68 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3371  hypothetical protein  28.2 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1577  putative formate dehydrogenase formation protein  25.14 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.396578  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0645  formate dehydrogenase accessory protein  35.71 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0493202 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0045  hypothetical protein  23.21 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0796  hypothetical protein  23.1 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.230718  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1004  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  25.17 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2375  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  26.64 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.826547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0285  formate dehydrogenase accessory protein  35.71 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.135303  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2589  hypothetical protein  32.31 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1117  hypothetical protein  28.08 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1276  hypothetical protein  25.43 
 
 		 300 aa  67  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.849487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3041  putative formate dehydrogenase formation protein  32.28 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.856963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1822  putative formate dehydrogenase formation protein FdhE  34.83 
 
 		 256 aa  65.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1233  formate dehydrogenase accessory protein  29.15 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0243277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0871  hypothetical protein  38.3 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0456  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.624877 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0982  formate dehydrogenase accessory protein  33.33 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0608  formate dehydrogenase accessory protein  22.64 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0103  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  28.96 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0104  fdhE protein  30.43 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0107  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  30.63 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0108  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  30.63 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2086  putative formate dehydrogenase formation protein  29.79 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3590  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  28.57 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.510238  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1815  formate dehydrogenase accessory protein  26.27 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.608787  normal  0.064168 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1791  putative formate dehydrogenase formation protein  29.08 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0100  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  28.57 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1870  formate dehydrogenase accessory protein  29.08 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.45516  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0105  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  28.57 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0105  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  28.57 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11250  uncharacterized protein involved in formate dehydrogenase formation  29.85 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.787821  normal  0.730398 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4093  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  32.06 
 
 		 309 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0041  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.36 
 
 		 309 aa  53.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4116  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.36 
 
 		 309 aa  53.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3767  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.36 
 
 		 309 aa  53.5  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4127  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  32.06 
 
 		 309 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4119  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  32.06 
 
 		 309 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03725  hypothetical protein  32.06 
 
 		 309 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1432  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  30.25 
 
 		 311 aa  52.8  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03776  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  32.06 
 
 		 309 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4277  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  32.06 
 
 		 309 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2515  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.4 
 
 		 309 aa  52.8  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2701  formate dehydrogenase accessory protein  31.87 
 
 		 308 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.985354  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4370  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  32.06 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03840  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  28.91 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4420  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  32.06 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0087  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.4 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5341  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  32.06 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0441  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  26.32 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2550  formate dehydrogenase accessory protein  28.37 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.469755  normal  0.436108 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4268  putative formate dehydrogenase formation protein FdhE  29.79 
 
 		 242 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.023402  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1525  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  30.25 
 
 		 309 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2743  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  30.58 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2092  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  30.48 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039183 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6557  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  28.37 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232874  decreased coverage  0.000781967 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3897  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  32.37 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4088  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  28.57 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21810  uncharacterized protein involved in formate dehydrogenase formation  30.77 
 
 		 304 aa  47.8  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.218643 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4314  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.15 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4360  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.15 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.382122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4247  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.15 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3813  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  28.78 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4269  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.15 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4425  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.15 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.248516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0547  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  29.33 
 
 		 316 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.178181 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1679  formate dehydrogenase accessory protein  27.27 
 
 		 300 aa  46.2  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0290178  normal  0.051951 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3328  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  25.98 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.518348 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2097  formate dehydrogenase accessory protein  28.12 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.162147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4379  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  28.12 
 
 		 316 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.855008  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3987  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  28.12 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3380  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  28.12 
 
 		 338 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3757  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  34.65 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4594  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  27.34 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0729287  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4521  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  26.35 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.269585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3882  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  28.12 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.884672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3541  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  28.12 
 
 		 311 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0540431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0710  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  27.92 
 
 		 320 aa  43.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3487  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  28.57 
 
 		 324 aa  43.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2011  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  28.65 
 
 		 288 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.716423  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>