110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0608 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0608  formate dehydrogenase accessory protein  100 
 
 
289 aa  595  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1117  hypothetical protein  30 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1332  uncharacterized protein involved in formate dehydrogenase formation  26.97 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1572  uncharacterized protein involved in formate dehydrogenase formation-like protein  33.99 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0045  hypothetical protein  27.12 
 
 
277 aa  77  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2641  formate dehydrogenase accessory protein  33.33 
 
 
280 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0951215 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0706  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  32.73 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1276  hypothetical protein  27.66 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.849487  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1577  putative formate dehydrogenase formation protein  24.14 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.396578  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0279  formate dehydrogenase accessory protein  27.14 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_174  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase accessory protein  27.63 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105783  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1197  formate dehydrogenase accessory protein  27.92 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3590  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  33.64 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.510238  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1004  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  33.63 
 
 
280 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0185  formate dehydrogenase accessory protein FdhE, putative  26.94 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0982  formate dehydrogenase accessory protein  25.84 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03840  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  35.77 
 
 
304 aa  67  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0167  hypothetical protein  24.55 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000455155  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2375  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  30.63 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.826547  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3371  hypothetical protein  27.37 
 
 
281 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0456  hypothetical protein  30.28 
 
 
282 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.624877 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2589  hypothetical protein  30.6 
 
 
282 aa  62.8  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1525  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  30.83 
 
 
309 aa  62.8  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3041  putative formate dehydrogenase formation protein  32.11 
 
 
286 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.856963  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1089  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  34.78 
 
 
331 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.75102  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6557  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.71 
 
 
331 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232874  decreased coverage  0.000781967 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1791  putative formate dehydrogenase formation protein  30 
 
 
276 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1233  formate dehydrogenase accessory protein  27.93 
 
 
303 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0243277 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1870  formate dehydrogenase accessory protein  30 
 
 
276 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.45516  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2743  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  30.83 
 
 
309 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2097  formate dehydrogenase accessory protein  33.04 
 
 
316 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.162147  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3515  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  22.64 
 
 
307 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3987  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  33.04 
 
 
316 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4594  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  33.04 
 
 
316 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0729287  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3541  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  33.04 
 
 
311 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0540431  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0648  formate dehydrogenase accessory protein  23.86 
 
 
321 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244649 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4379  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  33.04 
 
 
316 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.855008  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3380  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  33.04 
 
 
338 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0038  protein involved in formate dehydrogenase formation  31.03 
 
 
336 aa  60.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000731666  normal  0.296733 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3882  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  33.04 
 
 
311 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.884672  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1679  formate dehydrogenase accessory protein  27.18 
 
 
300 aa  60.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0290178  normal  0.051951 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1432  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.97 
 
 
311 aa  60.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2086  putative formate dehydrogenase formation protein  29.09 
 
 
276 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2550  formate dehydrogenase accessory protein  31.45 
 
 
331 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.469755  normal  0.436108 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0710  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  32.17 
 
 
320 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2515  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.97 
 
 
309 aa  60.1  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1815  formate dehydrogenase accessory protein  30 
 
 
302 aa  59.3  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.608787  normal  0.064168 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0871  hypothetical protein  29.66 
 
 
251 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0727  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  32.17 
 
 
322 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2256  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  32.17 
 
 
322 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308302  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0796  hypothetical protein  20 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.230718  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0503  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  24.72 
 
 
315 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1680  formate dehydrogenase accessory protein  32.17 
 
 
322 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1695  formate dehydrogenase accessory protein  32.17 
 
 
322 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.672608  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1902  formate dehydrogenase accessory protein  32.17 
 
 
322 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2393  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  32.17 
 
 
322 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0413827  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0574  formate dehydrogenase accessory protein  32.17 
 
 
322 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.893619  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4521  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  33.04 
 
 
310 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.269585  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0557  formate dehydrogenase accessory protein  24.61 
 
 
325 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3328  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.58 
 
 
309 aa  57  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.518348 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4314  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  34.19 
 
 
309 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4360  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  34.19 
 
 
309 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.382122  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4247  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  34.19 
 
 
309 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4269  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  34.19 
 
 
309 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4425  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  34.19 
 
 
309 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.248516  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0441  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.62 
 
 
323 aa  55.8  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4093  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  29.57 
 
 
309 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63550  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  28.57 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0301804  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4088  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  29.82 
 
 
309 aa  55.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5528  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  29.22 
 
 
309 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.788402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4420  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  29.57 
 
 
309 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5341  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  29.57 
 
 
309 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.535086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03776  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  29.57 
 
 
309 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4116  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  30.51 
 
 
309 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4119  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  29.57 
 
 
309 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3767  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  30.51 
 
 
309 aa  54.3  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0041  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  30.51 
 
 
309 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4127  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  29.57 
 
 
309 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4277  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  29.57 
 
 
309 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4370  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  29.57 
 
 
309 aa  55.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03725  hypothetical protein  29.57 
 
 
309 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2011  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  30 
 
 
288 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.716423  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0087  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  28.7 
 
 
309 aa  53.9  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0645  formate dehydrogenase accessory protein  26.32 
 
 
337 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0493202 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3487  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  29.05 
 
 
324 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18777  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3813  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  29 
 
 
284 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2826  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  29.08 
 
 
302 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.366284  normal  0.421653 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3897  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  28 
 
 
284 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1568  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  29.41 
 
 
311 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2701  formate dehydrogenase accessory protein  31.58 
 
 
308 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.985354  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0285  formate dehydrogenase accessory protein  31.03 
 
 
273 aa  50.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.135303  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0104  fdhE protein  29.46 
 
 
302 aa  50.1  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0535  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  32.5 
 
 
306 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.849545 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0492  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  32.5 
 
 
318 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.379246 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0103  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  27.68 
 
 
301 aa  49.3  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0659  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  28.8 
 
 
317 aa  49.3  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0343732  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0108  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  27.68 
 
 
301 aa  49.3  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0526  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  32.5 
 
 
308 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.963128 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0107  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  27.43 
 
 
301 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3757  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.51 
 
 
284 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>