109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4425 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4425  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  100 
 
 		 309 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.248516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4314  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  98.06 
 
 		 309 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4360  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  98.06 
 
 		 309 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.382122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4247  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  98.06 
 
 		 309 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4269  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  98.06 
 
 		 309 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4088  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  92.88 
 
 		 309 aa  604  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03776  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  92.23 
 
 		 309 aa  596  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4119  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  92.23 
 
 		 309 aa  596  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4420  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  92.23 
 
 		 309 aa  595  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4127  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  92.23 
 
 		 309 aa  596  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4277  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  91.91 
 
 		 309 aa  595  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5341  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  92.23 
 
 		 309 aa  595  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03725  hypothetical protein  92.23 
 
 		 309 aa  596  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4093  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  91.91 
 
 		 309 aa  593  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4370  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  91.91 
 
 		 309 aa  592  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0087  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  70.45 
 
 		 309 aa  450  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4116  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  68.93 
 
 		 309 aa  444  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3767  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  68.93 
 
 		 309 aa  444  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0041  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  68.93 
 
 		 309 aa  444  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1525  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  67.97 
 
 		 309 aa  442  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2743  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  66.67 
 
 		 309 aa  434  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2515  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  65.26 
 
 		 309 aa  430  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1432  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  65.36 
 
 		 311 aa  419  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03840  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  50.98 
 
 		 304 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4521  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  42.47 
 
 		 310 aa  219  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.269585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4594  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  40.42 
 
 		 316 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0729287  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3380  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  40.77 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3882  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  38.96 
 
 		 311 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.884672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2097  formate dehydrogenase accessory protein  40.42 
 
 		 316 aa  205  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.162147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0710  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  39.67 
 
 		 320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63550  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  38.85 
 
 		 309 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0301804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2256  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  39.67 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308302  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5528  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  38.7 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.788402  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1680  formate dehydrogenase accessory protein  39.67 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0727  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  39.67 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1695  formate dehydrogenase accessory protein  39.67 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.672608  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1902  formate dehydrogenase accessory protein  39.67 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2393  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  39.67 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0413827  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0574  formate dehydrogenase accessory protein  39.67 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.893619  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2550  formate dehydrogenase accessory protein  38.14 
 
 		 331 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.469755  normal  0.436108 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0441  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  35.94 
 
 		 323 aa  192  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6557  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  37.78 
 
 		 331 aa  192  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232874  decreased coverage  0.000781967 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2092  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  33.81 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0492  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  38.64 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.379246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0526  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  38.64 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.963128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3487  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  38.74 
 
 		 324 aa  189  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3987  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  39.85 
 
 		 316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3541  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  38.31 
 
 		 311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0540431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4379  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  39.85 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.855008  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0547  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  37.97 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.178181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0535  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  37.54 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849545 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1815  formate dehydrogenase accessory protein  37.1 
 
 		 302 aa  179  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.608787  normal  0.064168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2701  formate dehydrogenase accessory protein  36.13 
 
 		 308 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.985354  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0104  fdhE protein  33.33 
 
 		 302 aa  170  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0107  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  33.09 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0105  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  33.33 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0100  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  33.33 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0105  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  33.33 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0103  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  32.17 
 
 		 301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0108  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  32.04 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3590  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  32.41 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.510238  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0659  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  34.04 
 
 		 317 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0343732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2011  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  35.86 
 
 		 288 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.716423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3328  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  33.58 
 
 		 309 aa  142  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.518348 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2866  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  30.24 
 
 		 303 aa  129  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0914212  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2826  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  33 
 
 		 302 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.366284  normal  0.421653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1089  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.97 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.75102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3264  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  32.15 
 
 		 327 aa  119  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.466325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3897  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.93 
 
 		 284 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3813  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  34.72 
 
 		 284 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3757  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  43.88 
 
 		 284 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0706  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  29.71 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2375  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  26.16 
 
 		 293 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.826547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1117  hypothetical protein  28.34 
 
 		 269 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0982  formate dehydrogenase accessory protein  24.89 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1197  formate dehydrogenase accessory protein  25.77 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1577  putative formate dehydrogenase formation protein  30.09 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.396578  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1233  formate dehydrogenase accessory protein  33.33 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0243277 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11250  uncharacterized protein involved in formate dehydrogenase formation  33.02 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.787821  normal  0.730398 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0796  hypothetical protein  24.68 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.230718  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1572  uncharacterized protein involved in formate dehydrogenase formation-like protein  31.53 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2641  formate dehydrogenase accessory protein  31.53 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0951215 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0279  formate dehydrogenase accessory protein  30 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1332  uncharacterized protein involved in formate dehydrogenase formation  26.58 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0871  hypothetical protein  31.03 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21810  uncharacterized protein involved in formate dehydrogenase formation  36.7 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.218643 
 
 
-
 
NC_002936  DET0185  formate dehydrogenase accessory protein FdhE, putative  30.97 
 
 		 282 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0456  hypothetical protein  28.99 
 
 		 282 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.624877 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3041  putative formate dehydrogenase formation protein  30.58 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.856963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0038  protein involved in formate dehydrogenase formation  31.97 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000731666  normal  0.296733 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0167  hypothetical protein  29.8 
 
 		 282 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000455155  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0045  hypothetical protein  25 
 
 		 277 aa  57  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0608  formate dehydrogenase accessory protein  34.19 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2086  putative formate dehydrogenase formation protein  26.4 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_174  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase accessory protein  31.93 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105783  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3371  hypothetical protein  34.82 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2589  hypothetical protein  26.24 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1004  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  28.7 
 
 		 280 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1791  putative formate dehydrogenase formation protein  26.4 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1870  formate dehydrogenase accessory protein  26.4 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.45516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>