102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0547 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0547  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  100 
 
 
316 aa  631  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.178181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0492  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  88.25 
 
 
318 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.379246 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0535  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  88.56 
 
 
306 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.849545 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0526  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  87.66 
 
 
308 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.963128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2701  formate dehydrogenase accessory protein  62.75 
 
 
308 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.985354  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63550  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  59.67 
 
 
309 aa  345  4e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0301804  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5528  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  59.67 
 
 
309 aa  345  5e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.788402  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4521  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  37.62 
 
 
310 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.269585  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4093  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  39.32 
 
 
309 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4277  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  39.32 
 
 
309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03776  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  39.32 
 
 
309 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4119  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  39.32 
 
 
309 aa  189  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4127  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  39.32 
 
 
309 aa  189  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03725  hypothetical protein  39.32 
 
 
309 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4420  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  38.98 
 
 
309 aa  189  8e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5341  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  38.98 
 
 
309 aa  189  8e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4314  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  38.64 
 
 
309 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4360  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  38.64 
 
 
309 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.382122  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4247  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  38.64 
 
 
309 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4269  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  38.64 
 
 
309 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4370  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  38.64 
 
 
309 aa  186  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2743  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  38.51 
 
 
309 aa  185  7e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4425  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  37.97 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.248516  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1432  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  39.2 
 
 
311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1525  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  38.83 
 
 
309 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4088  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  37.76 
 
 
309 aa  179  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4594  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  37.99 
 
 
316 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0729287  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2515  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  37.58 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3380  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  36.93 
 
 
338 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3882  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  36.93 
 
 
311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.884672  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2097  formate dehydrogenase accessory protein  36.93 
 
 
316 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.162147  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1815  formate dehydrogenase accessory protein  38.02 
 
 
302 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.608787  normal  0.064168 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4116  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  37.33 
 
 
309 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3767  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  37.33 
 
 
309 aa  169  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0041  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  37.33 
 
 
309 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2256  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  35.37 
 
 
322 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308302  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0727  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  35.37 
 
 
322 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6557  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  36.2 
 
 
331 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232874  decreased coverage  0.000781967 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1680  formate dehydrogenase accessory protein  35.37 
 
 
322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1695  formate dehydrogenase accessory protein  35.37 
 
 
322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.672608  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1902  formate dehydrogenase accessory protein  35.37 
 
 
322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2393  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  35.37 
 
 
322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0413827  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0574  formate dehydrogenase accessory protein  35.37 
 
 
322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.893619  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2550  formate dehydrogenase accessory protein  36.65 
 
 
331 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.469755  normal  0.436108 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0710  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  34.94 
 
 
320 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0087  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  35.69 
 
 
309 aa  159  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3487  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  37.06 
 
 
324 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18777  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3541  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  35.98 
 
 
311 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0540431  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4379  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  35.98 
 
 
316 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.855008  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3987  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  35.98 
 
 
316 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0659  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  33.44 
 
 
317 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0343732  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2092  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  32.74 
 
 
299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039183 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03840  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  41.96 
 
 
304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3590  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  30.46 
 
 
303 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.510238  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3328  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  33.21 
 
 
309 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.518348 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2866  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  35.2 
 
 
303 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0914212  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0103  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.56 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0108  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.56 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0104  fdhE protein  31.33 
 
 
302 aa  127  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0107  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.23 
 
 
301 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0105  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.33 
 
 
302 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0100  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.33 
 
 
302 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0105  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.33 
 
 
302 aa  124  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1089  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  32.45 
 
 
331 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.75102  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0441  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  29.07 
 
 
323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2011  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  36.05 
 
 
288 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.716423  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3897  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  37.09 
 
 
284 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3813  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  37.09 
 
 
284 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3264  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  36.36 
 
 
327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.466325  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2826  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  33.99 
 
 
302 aa  105  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.366284  normal  0.421653 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3757  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  35.41 
 
 
284 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0706  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  35.83 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0982  formate dehydrogenase accessory protein  29.41 
 
 
294 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2375  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  32.45 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.826547  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0871  hypothetical protein  35.25 
 
 
251 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1004  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  33.91 
 
 
280 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1233  formate dehydrogenase accessory protein  35.04 
 
 
303 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0243277 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0279  formate dehydrogenase accessory protein  25.26 
 
 
294 aa  62  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3371  hypothetical protein  28.81 
 
 
281 aa  59.7  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1791  putative formate dehydrogenase formation protein  28.74 
 
 
276 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1870  formate dehydrogenase accessory protein  28.74 
 
 
276 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.45516  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3041  putative formate dehydrogenase formation protein  30.67 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.856963  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1572  uncharacterized protein involved in formate dehydrogenase formation-like protein  31.45 
 
 
280 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2641  formate dehydrogenase accessory protein  31.45 
 
 
280 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0951215 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1197  formate dehydrogenase accessory protein  30.08 
 
 
265 aa  57  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2086  putative formate dehydrogenase formation protein  28.14 
 
 
276 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0645  formate dehydrogenase accessory protein  31.3 
 
 
337 aa  55.8  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0493202 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0167  hypothetical protein  33.62 
 
 
282 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000455155  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1117  hypothetical protein  29.95 
 
 
269 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_174  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase accessory protein  32.76 
 
 
282 aa  52.4  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105783  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0185  formate dehydrogenase accessory protein FdhE, putative  32.76 
 
 
282 aa  52  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1577  putative formate dehydrogenase formation protein  27.35 
 
 
282 aa  51.2  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.396578  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11250  uncharacterized protein involved in formate dehydrogenase formation  31.19 
 
 
305 aa  50.8  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.787821  normal  0.730398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0456  hypothetical protein  30.89 
 
 
282 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.624877 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0038  protein involved in formate dehydrogenase formation  27.96 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000731666  normal  0.296733 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21810  uncharacterized protein involved in formate dehydrogenase formation  30.09 
 
 
304 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.218643 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0608  formate dehydrogenase accessory protein  30.83 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0796  hypothetical protein  24.39 
 
 
275 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.230718  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1822  putative formate dehydrogenase formation protein FdhE  31.36 
 
 
256 aa  47.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2589  hypothetical protein  29.06 
 
 
282 aa  47  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>