68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1568 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1568  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  100 
 
 		 311 aa  634    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3515  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  33.66 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0038  protein involved in formate dehydrogenase formation  26.87 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000731666  normal  0.296733 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1117  hypothetical protein  32.03 
 
 		 269 aa  86.3  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1332  uncharacterized protein involved in formate dehydrogenase formation  31.65 
 
 		 272 aa  86.3  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0648  formate dehydrogenase accessory protein  32.58 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244649 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0557  formate dehydrogenase accessory protein  33.58 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0645  formate dehydrogenase accessory protein  32.91 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0493202 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0279  formate dehydrogenase accessory protein  28.92 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0503  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  31.82 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1233  formate dehydrogenase accessory protein  29.17 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0243277 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0706  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  29.01 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3371  hypothetical protein  31.18 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1572  uncharacterized protein involved in formate dehydrogenase formation-like protein  26.85 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2375  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  27.14 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.826547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2086  putative formate dehydrogenase formation protein  28.92 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2589  hypothetical protein  23.89 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2641  formate dehydrogenase accessory protein  27.52 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0951215 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1791  putative formate dehydrogenase formation protein  27.94 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1870  formate dehydrogenase accessory protein  30.87 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.45516  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1577  putative formate dehydrogenase formation protein  22.09 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.396578  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_174  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase accessory protein  22.93 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105783  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0456  hypothetical protein  29.92 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.624877 
 
 
-
 
NC_002936  DET0185  formate dehydrogenase accessory protein FdhE, putative  23.41 
 
 		 282 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0796  hypothetical protein  26.96 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.230718  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0108  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  25.93 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1197  formate dehydrogenase accessory protein  28.1 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0103  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  25.93 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0167  hypothetical protein  21.58 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000455155  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3041  putative formate dehydrogenase formation protein  27.5 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.856963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0107  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  25.93 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0871  hypothetical protein  32.98 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1004  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  31.67 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1276  hypothetical protein  27.27 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.849487  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0104  fdhE protein  27.64 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03840  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  36.97 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0100  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  27.64 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0105  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  27.64 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0105  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  27.64 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0982  formate dehydrogenase accessory protein  26.35 
 
 		 294 aa  52.8  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0608  formate dehydrogenase accessory protein  29.41 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1679  formate dehydrogenase accessory protein  26.47 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0290178  normal  0.051951 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0045  hypothetical protein  21.91 
 
 		 277 aa  49.3  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2515  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  30.95 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2092  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  28.46 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039183 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1432  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  30.16 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5341  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  29.92 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4420  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  29.92 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4093  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  29.92 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4370  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  29.92 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03776  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  29.92 
 
 		 309 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4277  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  29.92 
 
 		 309 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4127  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  29.92 
 
 		 309 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03725  hypothetical protein  29.92 
 
 		 309 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4119  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  29.92 
 
 		 309 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21810  uncharacterized protein involved in formate dehydrogenase formation  27.74 
 
 		 304 aa  45.8  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.218643 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11250  uncharacterized protein involved in formate dehydrogenase formation  27.06 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.787821  normal  0.730398 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2550  formate dehydrogenase accessory protein  26.09 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.469755  normal  0.436108 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2743  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  33.07 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0087  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  30.4 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6557  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  26.81 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232874  decreased coverage  0.000781967 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1525  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  32.28 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3767  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.5 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0041  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.5 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4116  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.5 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3328  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  28.23 
 
 		 309 aa  43.1  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.518348 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3757  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  30.21 
 
 		 284 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0659  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  30.63 
 
 		 317 aa  42.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0343732  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>