109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4370 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03776  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  99.03 
 
 		 309 aa  634    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4119  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  99.03 
 
 		 309 aa  634    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4420  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  99.68 
 
 		 309 aa  637    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4127  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  99.03 
 
 		 309 aa  634    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4277  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  98.71 
 
 		 309 aa  633    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4370  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  100 
 
 		 309 aa  639    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5341  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  99.68 
 
 		 309 aa  637    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03725  hypothetical protein  99.03 
 
 		 309 aa  634    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4093  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  98.71 
 
 		 309 aa  631  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4314  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  93.85 
 
 		 309 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4360  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  93.85 
 
 		 309 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.382122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4247  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  93.85 
 
 		 309 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4269  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  93.85 
 
 		 309 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4425  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  91.91 
 
 		 309 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.248516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4088  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  88.67 
 
 		 309 aa  576  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4116  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  69.26 
 
 		 309 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0087  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  69.48 
 
 		 309 aa  446  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3767  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  69.26 
 
 		 309 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0041  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  69.26 
 
 		 309 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2515  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  67.53 
 
 		 309 aa  441  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1525  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  67.65 
 
 		 309 aa  434  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1432  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  67.65 
 
 		 311 aa  432  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2743  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  66.01 
 
 		 309 aa  427  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03840  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  51.63 
 
 		 304 aa  293  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4521  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  41.81 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.269585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4594  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  41.72 
 
 		 316 aa  209  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0729287  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2097  formate dehydrogenase accessory protein  41.72 
 
 		 316 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.162147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3380  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  41.11 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3882  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  39.29 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.884672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2092  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  36.69 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039183 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0441  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  37.37 
 
 		 323 aa  199  6e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0710  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  39.67 
 
 		 320 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1680  formate dehydrogenase accessory protein  39.67 
 
 		 322 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0727  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  39.67 
 
 		 322 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1695  formate dehydrogenase accessory protein  39.67 
 
 		 322 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.672608  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1902  formate dehydrogenase accessory protein  39.67 
 
 		 322 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2393  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  39.67 
 
 		 322 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0413827  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2256  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  39.67 
 
 		 322 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308302  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0574  formate dehydrogenase accessory protein  39.67 
 
 		 322 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.893619  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6557  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  38.41 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232874  decreased coverage  0.000781967 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2550  formate dehydrogenase accessory protein  38.46 
 
 		 331 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.469755  normal  0.436108 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63550  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  39.19 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0301804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5528  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  38.85 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.788402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3987  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  41.35 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3541  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  41.35 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0540431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4379  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  41.35 
 
 		 316 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.855008  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0547  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  38.64 
 
 		 316 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.178181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3487  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  37.33 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2701  formate dehydrogenase accessory protein  38.06 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.985354  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0526  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  38.31 
 
 		 308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.963128 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0492  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  38.31 
 
 		 318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.379246 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0104  fdhE protein  35.46 
 
 		 302 aa  178  9e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0535  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  37.54 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849545 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0107  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  35.27 
 
 		 301 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0105  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  35.46 
 
 		 302 aa  175  7e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0100  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  35.46 
 
 		 302 aa  175  7e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0105  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  35.46 
 
 		 302 aa  175  7e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1815  formate dehydrogenase accessory protein  36.4 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.608787  normal  0.064168 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0103  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  34.27 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0108  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  34.89 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0659  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  34.39 
 
 		 317 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0343732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3590  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.25 
 
 		 303 aa  155  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.510238  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2011  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  35.86 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.716423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3328  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  33.58 
 
 		 309 aa  146  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.518348 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2866  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.27 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0914212  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2826  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  34.62 
 
 		 302 aa  125  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.366284  normal  0.421653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1089  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  32.98 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.75102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3264  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.75 
 
 		 327 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.466325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3897  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  33.33 
 
 		 284 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3813  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  33.33 
 
 		 284 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3757  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  42.45 
 
 		 284 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0706  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  30.93 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2375  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  26.49 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.826547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0982  formate dehydrogenase accessory protein  30.25 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1117  hypothetical protein  33.33 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1577  putative formate dehydrogenase formation protein  31.58 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.396578  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1197  formate dehydrogenase accessory protein  25.77 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1233  formate dehydrogenase accessory protein  34.15 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0243277 
 
 
-
 
NC_002936  DET0185  formate dehydrogenase accessory protein FdhE, putative  33.11 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11250  uncharacterized protein involved in formate dehydrogenase formation  33.02 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.787821  normal  0.730398 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0279  formate dehydrogenase accessory protein  26.6 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0167  hypothetical protein  32.26 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000455155  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1332  uncharacterized protein involved in formate dehydrogenase formation  26.92 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0796  hypothetical protein  25.2 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.230718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2641  formate dehydrogenase accessory protein  30.77 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0951215 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0871  hypothetical protein  24.47 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_174  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase accessory protein  30.97 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105783  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1572  uncharacterized protein involved in formate dehydrogenase formation-like protein  29.91 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21810  uncharacterized protein involved in formate dehydrogenase formation  34.23 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.218643 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0456  hypothetical protein  28.03 
 
 		 282 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.624877 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3041  putative formate dehydrogenase formation protein  30.33 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.856963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2086  putative formate dehydrogenase formation protein  27.2 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1791  putative formate dehydrogenase formation protein  27.2 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1870  formate dehydrogenase accessory protein  27.2 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.45516  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1004  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  29.57 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2589  hypothetical protein  26.57 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3371  hypothetical protein  33.33 
 
 		 281 aa  57  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1679  formate dehydrogenase accessory protein  32.65 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0290178  normal  0.051951 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0608  formate dehydrogenase accessory protein  29.57 
 
 		 289 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0038  protein involved in formate dehydrogenase formation  33.33 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000731666  normal  0.296733 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>