123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1190 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1190  cobalt transport protein CbiM  100 
 
 
204 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000465772  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3138  cobalt transport protein CbiM  67.01 
 
 
208 aa  241  6e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3139  cobalt transport protein CbiM  64.29 
 
 
204 aa  228  5e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2022  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  54.31 
 
 
197 aa  208  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000920884  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0756  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  51.79 
 
 
204 aa  189  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.535261  normal  0.785347 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1471  cobalt transport protein CbiM  62.44 
 
 
207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.699456  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1959  cobalt transport protein CbiM  47.98 
 
 
208 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1951  cobalt transport protein CbiM  55.84 
 
 
211 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70301  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3500  cobalt transport protein CbiM  48.78 
 
 
211 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1936  cobalt transport protein CbiM  61.76 
 
 
204 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3436  cobalt transport protein CbiM  50.52 
 
 
203 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.790482  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1133  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  46.43 
 
 
198 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.540876 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1346  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  45.92 
 
 
198 aa  149  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0137458  unclonable  0.00000105881 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3140  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  46.23 
 
 
430 aa  147  9e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00188953  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2093  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  43.37 
 
 
201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00179951  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1365  cobalt transport protein CbiM  43.59 
 
 
211 aa  138  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1321  cobalt transport protein CbiM  43.59 
 
 
211 aa  138  6e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3207  cobalt transport protein CbiM  44.12 
 
 
205 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.268984  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0171  cobalt transport protein CbiM  40.61 
 
 
194 aa  122  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2474  cobalt transport protein CbiM  35 
 
 
201 aa  121  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0557  cobalt transport protein CbiM  36.73 
 
 
195 aa  112  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.583466  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0543  cobalt transport protein CbiM  37.37 
 
 
193 aa  112  5e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3947  cobalt transport protein CbiM  45.32 
 
 
205 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2782  cobalt transport protein CbiM  37.09 
 
 
214 aa  102  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104857  decreased coverage  0.00186647 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2131  cobalt transport protein CbiM  37.2 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1044  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.41 
 
 
246 aa  75.1  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.116161 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2184  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.65 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00256059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0772  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.43 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0519153  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.43 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2291  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.84 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.372139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2063  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.25 
 
 
232 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2109  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.25 
 
 
232 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494306  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2046  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.25 
 
 
232 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4058  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.45 
 
 
235 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.815174  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1085  hypothetical protein  32.26 
 
 
231 aa  63.9  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1739  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.14 
 
 
204 aa  62.8  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.749284  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1351  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.41 
 
 
233 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.309906  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0062  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.85 
 
 
213 aa  61.6  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000311798  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.02 
 
 
229 aa  61.6  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1755  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.56 
 
 
306 aa  61.6  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379762  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3808  cobalt transport protein CbiM  33.49 
 
 
245 aa  61.6  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.19 
 
 
328 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0192  cobalt transport protein CbiM  30.53 
 
 
230 aa  60.5  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0108763  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3892  cobalt transport protein CbiM  31.82 
 
 
256 aa  58.9  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.885543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2134  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.23 
 
 
261 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1073  hypothetical protein  30.09 
 
 
599 aa  58.2  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2752  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.28 
 
 
354 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3004  cobalt transport protein CbiM  31.13 
 
 
321 aa  57  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0512  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.02 
 
 
343 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.21192 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0298  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.76 
 
 
213 aa  56.2  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.306858  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1292  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.53 
 
 
299 aa  55.5  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.46518  normal  0.800906 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0174  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.19 
 
 
326 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.801433  normal  0.632766 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1780  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.41 
 
 
307 aa  55.5  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347196  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0273  cobalt transport protein CbiM  34.33 
 
 
231 aa  54.3  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.163023  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0031  cobalt transport protein CbiM  25 
 
 
212 aa  53.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1003  cobalamin biosynthesis protein CbiM  29.52 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1959  cobalt transport protein CbiM  27.56 
 
 
226 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1702  cobalamin biosynthesis protein CbiM  30.36 
 
 
231 aa  53.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.254913  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1116  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.28 
 
 
238 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1927  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.77 
 
 
242 aa  52.4  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1006  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.56 
 
 
238 aa  52.4  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154415  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1480  cobalt transport protein CbiM  24.53 
 
 
213 aa  51.6  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4182  cobalt transport protein CbiM  30.19 
 
 
251 aa  52  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0531  cobalt transport protein CbiM  28.84 
 
 
230 aa  51.6  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2567  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.21 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.29234  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0681  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.54 
 
 
333 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0323  cobalt transport protein CbiM  28.68 
 
 
249 aa  50.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00019504  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0182  cobalt transport protein CbiM  28.24 
 
 
247 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2333  cobalt transport protein CbiM  25.68 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0185  cobalt transport protein CbiM  27.78 
 
 
247 aa  49.7  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.878644  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1766  cobalt transport protein CbiM  25.71 
 
 
212 aa  49.7  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1545  cobalt transport protein CbiM  30.09 
 
 
246 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2762  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.78 
 
 
348 aa  49.3  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0712  cobalamin biosynthesis protein CbiM  27.06 
 
 
235 aa  49.3  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1803  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  25.59 
 
 
352 aa  48.9  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2793  cobalt transport protein CbiM  30.92 
 
 
226 aa  48.5  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132935  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1385  cobalamin biosynthesis protein CbiM  29.47 
 
 
250 aa  48.1  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1327  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.52 
 
 
229 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.871033  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1569  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.33 
 
 
233 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.6 
 
 
202 aa  47  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2731  cobalamin biosynthesis protein CbiM  26.82 
 
 
250 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.480074  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2620  cobalt transport protein CbiM  29.38 
 
 
247 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0580  cobalt transport protein CbiM  29.91 
 
 
229 aa  46.6  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0330  cobalt transport protein CbiM  29.53 
 
 
325 aa  45.8  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0780  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.85 
 
 
348 aa  45.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000017293  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0790  cobalt transport protein CbiM  28.51 
 
 
225 aa  45.8  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2565  cobalt transport protein CbiM  25.39 
 
 
239 aa  45.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.779557  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1241  cobalt transport protein CbiM  30.32 
 
 
226 aa  45.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.335474  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2352  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.53 
 
 
310 aa  45.8  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6032  membrane protein  31.52 
 
 
217 aa  45.4  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1148  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.8 
 
 
218 aa  45.1  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00870535  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1226  cobalt transport protein CbiM  30.32 
 
 
226 aa  45.1  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00004415  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3660  cobalt transport protein CbiM  30.09 
 
 
225 aa  45.1  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0472  cobalt transport protein CbiM  30.19 
 
 
225 aa  45.1  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2621  cobalt transport protein CbiM  26.26 
 
 
214 aa  45.1  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.78373  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3205  cobalt transport protein CbiM  25.96 
 
 
229 aa  44.3  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0725  cobalt transport protein CbiM  28.3 
 
 
225 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.145999 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1182  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.82 
 
 
331 aa  44.3  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00505251  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0097  cobalt transport protein CbiM  27.36 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0137  cobalt transport protein CbiM  24.72 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0440058 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>