157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3892 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3892  cobalt transport protein CbiM  100 
 
 
256 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.885543 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3808  cobalt transport protein CbiM  95.1 
 
 
245 aa  450  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4182  cobalt transport protein CbiM  70.12 
 
 
251 aa  334  7e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3004  cobalt transport protein CbiM  74.89 
 
 
321 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0472  cobalt transport protein CbiM  73.33 
 
 
225 aa  310  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3205  cobalt transport protein CbiM  41.15 
 
 
229 aa  179  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1293  cobalamin biosynthesis protein CbiM  37.78 
 
 
232 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034572  normal  0.0275766 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2145  cobalt transport protein CbiM  40.44 
 
 
235 aa  170  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0808457  normal  0.37009 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1702  cobalamin biosynthesis protein CbiM  40.36 
 
 
231 aa  169  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.254913  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0146  cobalt transport protein CbiM  42.2 
 
 
221 aa  168  9e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0185688  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0580  cobalt transport protein CbiM  44.64 
 
 
229 aa  167  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1085  hypothetical protein  39.56 
 
 
231 aa  167  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1700  cobalt transport protein CbiM  39.56 
 
 
231 aa  166  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000112913  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0927  cobalamin biosynthesis protein CbiM  43.09 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326506  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1216  cobalt transport protein CbiM  38.03 
 
 
231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0531  cobalt transport protein CbiM  39.29 
 
 
230 aa  160  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0323  cobalt transport protein CbiM  39.24 
 
 
249 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00019504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1222  cobalt transport protein CbiM  40.99 
 
 
234 aa  157  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.955789  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2333  cobalt transport protein CbiM  37.33 
 
 
235 aa  156  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0097  cobalt transport protein CbiM  41.07 
 
 
225 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1193  cobalt transport protein CbiM  41.26 
 
 
225 aa  152  4e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0790  cobalt transport protein CbiM  39.82 
 
 
225 aa  151  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0725  cobalt transport protein CbiM  40.81 
 
 
225 aa  150  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.145999 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1003  cobalamin biosynthesis protein CbiM  37.5 
 
 
236 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1697  cobalt transport protein CbiM  42.92 
 
 
225 aa  149  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.30926 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0712  cobalamin biosynthesis protein CbiM  38.53 
 
 
235 aa  149  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1276  cobalamin biosynthesis protein CbiM  43.93 
 
 
246 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3736  cobalamin biosynthesis protein CbiM  39.38 
 
 
251 aa  148  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2731  cobalamin biosynthesis protein CbiM  40.27 
 
 
250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.480074  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2358  cobalt transport protein CbiM  43.17 
 
 
245 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.372857 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2620  cobalt transport protein CbiM  40.53 
 
 
247 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2245  cobalt transport protein CbiM  43.17 
 
 
245 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.112187 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2145  cobalt transport protein CbiM  43.17 
 
 
245 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2199  cobalt transport protein CbiM  43.17 
 
 
245 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2192  cobalt transport protein CbiM  43.17 
 
 
245 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0560  cobalamin biosynthesis protein CbiM  42.11 
 
 
249 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1545  cobalt transport protein CbiM  38.12 
 
 
246 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221341  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1709  cobalamin biosynthesis protein CbiM  39.27 
 
 
248 aa  141  8e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0543  cobalamin biosynthesis protein CbiM  44.6 
 
 
226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3660  cobalt transport protein CbiM  39.38 
 
 
225 aa  135  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1073  hypothetical protein  38.6 
 
 
599 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2601  cobalt transport protein CbiM  38.57 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.184682  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0380  hypothetical protein  37.33 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1241  cobalt transport protein CbiM  42.86 
 
 
226 aa  131  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.335474  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1759  cobalt transport protein CbiM  40.61 
 
 
228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0182  cobalt transport protein CbiM  36.49 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1226  cobalt transport protein CbiM  41.44 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00004415  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0185  cobalt transport protein CbiM  36.49 
 
 
247 aa  129  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.878644  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1060  cobalt transport protein CbiM  37.85 
 
 
254 aa  126  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2595  cobalt transport protein CbiM  41.74 
 
 
226 aa  125  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0918235  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2793  cobalt transport protein CbiM  42.2 
 
 
226 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132935  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4719  cobalamin biosynthesis protein CbiM  40.36 
 
 
225 aa  122  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3820  cobalt transport protein CbiM  40.2 
 
 
249 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1266  cobalamin biosynthesis protein CbiM  32.67 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1385  cobalamin biosynthesis protein CbiM  37 
 
 
250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3589  cobalamin biosynthesis protein CbiM  42.13 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2184  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.78 
 
 
241 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00256059 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1861  cobalamin biosynthesis protein CbiM  40.72 
 
 
224 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0031  cobalt transport protein CbiM  34.21 
 
 
212 aa  101  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0137  cobalt transport protein CbiM  34.36 
 
 
212 aa  99.4  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0440058 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1766  cobalt transport protein CbiM  35.68 
 
 
212 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1480  cobalt transport protein CbiM  34.11 
 
 
213 aa  97.4  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2621  cobalt transport protein CbiM  33.94 
 
 
214 aa  95.9  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.78373  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2291  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.51 
 
 
235 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.372139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2063  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  39.21 
 
 
232 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2109  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  39.21 
 
 
232 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494306  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2046  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  39.21 
 
 
232 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1006  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.33 
 
 
238 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154415  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.74 
 
 
241 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0772  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.74 
 
 
241 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0519153  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1044  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.82 
 
 
246 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.116161 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0090  cobalt transport protein CbiM  32.09 
 
 
210 aa  87.4  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2134  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  39.73 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1402  cobalt transport protein CbiM  33.95 
 
 
212 aa  85.9  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1116  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.33 
 
 
238 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1927  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.89 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4058  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.61 
 
 
235 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.815174  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0512  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.1 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.21192 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0882  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.62 
 
 
421 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0681  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.02 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1370  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.67 
 
 
232 aa  79  0.00000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.711039  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1739  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.16 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.749284  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1959  cobalt transport protein CbiM  31.72 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1793  cobalt transport protein CbiM  31.11 
 
 
218 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000128429  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0391  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.72 
 
 
202 aa  77.8  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.026574  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2565  cobalt transport protein CbiM  28.75 
 
 
239 aa  77  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.779557  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1351  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.89 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.309906  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1327  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.76 
 
 
229 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.871033  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.26 
 
 
328 aa  75.9  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0298  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.33 
 
 
213 aa  75.1  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.306858  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1148  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.75 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00870535  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2752  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.74 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1803  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.85 
 
 
352 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0993  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  42.11 
 
 
344 aa  72  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.05 
 
 
229 aa  72  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0213  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.13 
 
 
202 aa  72  0.000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.655003  normal  0.171707 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1767  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.66 
 
 
219 aa  72  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.113369  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1200  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.24 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.028093  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1780  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.73 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347196  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1755  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.38 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379762  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>