146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0097 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0097  cobalt transport protein CbiM  100 
 
 
225 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1193  cobalt transport protein CbiM  97.33 
 
 
225 aa  432  1e-120  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0725  cobalt transport protein CbiM  96.89 
 
 
225 aa  428  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.145999 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0790  cobalt transport protein CbiM  87.56 
 
 
225 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0146  cobalt transport protein CbiM  68.33 
 
 
221 aa  293  1e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0185688  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2145  cobalt transport protein CbiM  55.86 
 
 
235 aa  254  6e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0808457  normal  0.37009 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1702  cobalamin biosynthesis protein CbiM  56.7 
 
 
231 aa  246  3e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.254913  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1700  cobalt transport protein CbiM  56.56 
 
 
231 aa  239  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000112913  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1085  hypothetical protein  55.65 
 
 
231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0580  cobalt transport protein CbiM  54.15 
 
 
229 aa  231  9e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3205  cobalt transport protein CbiM  51.34 
 
 
229 aa  229  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1709  cobalamin biosynthesis protein CbiM  56.04 
 
 
248 aa  225  4e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1293  cobalamin biosynthesis protein CbiM  52.47 
 
 
232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034572  normal  0.0275766 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0560  cobalamin biosynthesis protein CbiM  54.05 
 
 
249 aa  223  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1216  cobalt transport protein CbiM  50.22 
 
 
231 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2333  cobalt transport protein CbiM  51.07 
 
 
235 aa  221  8e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1276  cobalamin biosynthesis protein CbiM  58.29 
 
 
246 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0531  cobalt transport protein CbiM  52.42 
 
 
230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1003  cobalamin biosynthesis protein CbiM  56.59 
 
 
236 aa  219  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1060  cobalt transport protein CbiM  54.17 
 
 
254 aa  215  4e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0712  cobalamin biosynthesis protein CbiM  53.24 
 
 
235 aa  214  8e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0927  cobalamin biosynthesis protein CbiM  50.45 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2601  cobalt transport protein CbiM  54.34 
 
 
246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.184682  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2731  cobalamin biosynthesis protein CbiM  53.81 
 
 
250 aa  211  9e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.480074  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1697  cobalt transport protein CbiM  53.12 
 
 
225 aa  210  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.30926 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1226  cobalt transport protein CbiM  53 
 
 
226 aa  210  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00004415  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3660  cobalt transport protein CbiM  51.56 
 
 
225 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2192  cobalt transport protein CbiM  51.44 
 
 
245 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2358  cobalt transport protein CbiM  51.44 
 
 
245 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.372857 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2145  cobalt transport protein CbiM  51.44 
 
 
245 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2199  cobalt transport protein CbiM  51.44 
 
 
245 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2245  cobalt transport protein CbiM  51.44 
 
 
245 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.112187 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1241  cobalt transport protein CbiM  52.53 
 
 
226 aa  207  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.335474  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2620  cobalt transport protein CbiM  52.94 
 
 
247 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0323  cobalt transport protein CbiM  51.1 
 
 
249 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00019504  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1545  cobalt transport protein CbiM  51.39 
 
 
246 aa  203  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221341  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3736  cobalamin biosynthesis protein CbiM  55.45 
 
 
251 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2793  cobalt transport protein CbiM  52.68 
 
 
226 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132935  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1222  cobalt transport protein CbiM  51.32 
 
 
234 aa  203  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.955789  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1073  hypothetical protein  48.7 
 
 
599 aa  201  8e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0182  cobalt transport protein CbiM  51.36 
 
 
247 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0185  cobalt transport protein CbiM  50.91 
 
 
247 aa  199  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.878644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1385  cobalamin biosynthesis protein CbiM  52.05 
 
 
250 aa  199  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4719  cobalamin biosynthesis protein CbiM  54.92 
 
 
225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1266  cobalamin biosynthesis protein CbiM  49.33 
 
 
248 aa  194  8.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1759  cobalt transport protein CbiM  54.39 
 
 
228 aa  191  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2595  cobalt transport protein CbiM  51.36 
 
 
226 aa  191  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0918235  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3820  cobalt transport protein CbiM  49.77 
 
 
249 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1861  cobalamin biosynthesis protein CbiM  51.38 
 
 
224 aa  185  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0380  hypothetical protein  50.23 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0543  cobalamin biosynthesis protein CbiM  49.1 
 
 
226 aa  178  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3589  cobalamin biosynthesis protein CbiM  49.75 
 
 
232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3004  cobalt transport protein CbiM  39.38 
 
 
321 aa  155  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3892  cobalt transport protein CbiM  41.26 
 
 
256 aa  153  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.885543 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4182  cobalt transport protein CbiM  42.11 
 
 
251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3808  cobalt transport protein CbiM  40.89 
 
 
245 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0472  cobalt transport protein CbiM  38.81 
 
 
225 aa  129  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0031  cobalt transport protein CbiM  35.07 
 
 
212 aa  94.7  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1766  cobalt transport protein CbiM  32.71 
 
 
212 aa  85.5  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0137  cobalt transport protein CbiM  32.24 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0440058 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2565  cobalt transport protein CbiM  28.7 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.779557  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0090  cobalt transport protein CbiM  29.91 
 
 
210 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1057  cobalt transport protein CbiM  36.23 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1767  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.29 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.113369  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0298  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.27 
 
 
213 aa  78.2  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.306858  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1739  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.44 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.749284  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1637  cobalt transport protein CbiM  34.59 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000771093 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.75 
 
 
229 aa  77  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2291  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.68 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.372139 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1480  cobalt transport protein CbiM  29.38 
 
 
213 aa  74.7  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1863  cobalt transport protein CbiM  29.78 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.292788  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1370  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.35 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.711039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1959  cobalt transport protein CbiM  31.16 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0772  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.04 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0519153  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.35 
 
 
241 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0512  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.82 
 
 
343 aa  72.4  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.21192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2184  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.31 
 
 
241 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00256059 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0391  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.13 
 
 
202 aa  72  0.000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.026574  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4058  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.33 
 
 
235 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.815174  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0192  cobalt transport protein CbiM  32.59 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0108763  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1044  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.16 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.116161 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.09 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118647  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2621  cobalt transport protein CbiM  26.82 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.78373  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0213  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.6 
 
 
202 aa  68.2  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.655003  normal  0.171707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2782  cobalt transport protein CbiM  31.34 
 
 
214 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104857  decreased coverage  0.00186647 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1450  cobalt transport protein CbiM  33.59 
 
 
226 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.208192  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0882  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.28 
 
 
421 aa  66.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2063  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.52 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2109  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.52 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494306  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.44 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2046  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.52 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.11 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1755  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.42 
 
 
306 aa  65.5  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379762  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2567  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.94 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.29234  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0681  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.44 
 
 
333 aa  65.1  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0174  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.25 
 
 
326 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.801433  normal  0.632766 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4293  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.82 
 
 
230 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1327  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.31 
 
 
229 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.871033  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3139  cobalt transport protein CbiM  32.41 
 
 
204 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0993  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.72 
 
 
344 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>