139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0712 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0712  cobalamin biosynthesis protein CbiM  100 
 
 		 235 aa  461  1e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0323  cobalt transport protein CbiM  63.45 
 
 		 249 aa  294  8e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00019504  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3736  cobalamin biosynthesis protein CbiM  59.57 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0927  cobalamin biosynthesis protein CbiM  64.49 
 
 		 250 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2601  cobalt transport protein CbiM  60.79 
 
 		 246 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.184682  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1222  cobalt transport protein CbiM  63.08 
 
 		 234 aa  270  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.955789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1060  cobalt transport protein CbiM  59.91 
 
 		 254 aa  270  2e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2731  cobalamin biosynthesis protein CbiM  59.15 
 
 		 250 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.480074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0185  cobalt transport protein CbiM  58.33 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.878644  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0182  cobalt transport protein CbiM  57.89 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2620  cobalt transport protein CbiM  60.09 
 
 		 247 aa  262  4e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1545  cobalt transport protein CbiM  60.18 
 
 		 246 aa  261  8e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221341  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1266  cobalamin biosynthesis protein CbiM  57.66 
 
 		 248 aa  259  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1276  cobalamin biosynthesis protein CbiM  57.75 
 
 		 246 aa  258  6e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1003  cobalamin biosynthesis protein CbiM  62.02 
 
 		 236 aa  257  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1241  cobalt transport protein CbiM  61.03 
 
 		 226 aa  257  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.335474  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1226  cobalt transport protein CbiM  60.56 
 
 		 226 aa  254  6e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00004415  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1709  cobalamin biosynthesis protein CbiM  54.77 
 
 		 248 aa  254  8e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0560  cobalamin biosynthesis protein CbiM  56.96 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3660  cobalt transport protein CbiM  59.91 
 
 		 225 aa  252  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1697  cobalt transport protein CbiM  60 
 
 		 225 aa  251  6e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.30926 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2199  cobalt transport protein CbiM  55.91 
 
 		 245 aa  250  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2245  cobalt transport protein CbiM  55.91 
 
 		 245 aa  250  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.112187 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2192  cobalt transport protein CbiM  55.91 
 
 		 245 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2145  cobalt transport protein CbiM  55.91 
 
 		 245 aa  250  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2358  cobalt transport protein CbiM  55.91 
 
 		 245 aa  250  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.372857 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1385  cobalamin biosynthesis protein CbiM  59.17 
 
 		 250 aa  249  3e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3820  cobalt transport protein CbiM  58.01 
 
 		 249 aa  241  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2793  cobalt transport protein CbiM  55.76 
 
 		 226 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132935  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3589  cobalamin biosynthesis protein CbiM  54.29 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3205  cobalt transport protein CbiM  56.52 
 
 		 229 aa  227  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1861  cobalamin biosynthesis protein CbiM  59.81 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2595  cobalt transport protein CbiM  55.76 
 
 		 226 aa  226  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0918235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2145  cobalt transport protein CbiM  53.67 
 
 		 235 aa  224  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0808457  normal  0.37009 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4719  cobalamin biosynthesis protein CbiM  58.33 
 
 		 225 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1759  cobalt transport protein CbiM  61.5 
 
 		 228 aa  224  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0725  cobalt transport protein CbiM  55.09 
 
 		 225 aa  221  9e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.145999 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2333  cobalt transport protein CbiM  54.11 
 
 		 235 aa  221  9e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0790  cobalt transport protein CbiM  55.09 
 
 		 225 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1702  cobalamin biosynthesis protein CbiM  52.53 
 
 		 231 aa  218  6e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.254913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1193  cobalt transport protein CbiM  54.17 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0543  cobalamin biosynthesis protein CbiM  52.53 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1293  cobalamin biosynthesis protein CbiM  53.37 
 
 		 232 aa  215  5e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034572  normal  0.0275766 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0097  cobalt transport protein CbiM  53.24 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0580  cobalt transport protein CbiM  54.25 
 
 		 229 aa  211  1e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1085  hypothetical protein  50.92 
 
 		 231 aa  210  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1216  cobalt transport protein CbiM  53.62 
 
 		 231 aa  209  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0531  cobalt transport protein CbiM  55.56 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1700  cobalt transport protein CbiM  50.93 
 
 		 231 aa  205  5e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000112913  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0146  cobalt transport protein CbiM  51.74 
 
 		 221 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0185688  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1073  hypothetical protein  44.19 
 
 		 599 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0380  hypothetical protein  48.26 
 
 		 259 aa  162  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3808  cobalt transport protein CbiM  38.2 
 
 		 245 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3892  cobalt transport protein CbiM  38.53 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.885543 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3004  cobalt transport protein CbiM  36.24 
 
 		 321 aa  148  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4182  cobalt transport protein CbiM  36.36 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0472  cobalt transport protein CbiM  38.14 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0137  cobalt transport protein CbiM  32.29 
 
 		 212 aa  99.4  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0440058 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0031  cobalt transport protein CbiM  31.75 
 
 		 212 aa  96.7  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1766  cobalt transport protein CbiM  33 
 
 		 212 aa  95.9  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1767  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.54 
 
 		 219 aa  95.9  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.113369  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0090  cobalt transport protein CbiM  33.18 
 
 		 210 aa  95.5  6e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1959  cobalt transport protein CbiM  27.73 
 
 		 226 aa  91.7  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0882  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.1 
 
 		 421 aa  90.1  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1480  cobalt transport protein CbiM  30.54 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1793  cobalt transport protein CbiM  31.95 
 
 		 218 aa  86.7  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000128429  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1637  cobalt transport protein CbiM  34.21 
 
 		 242 aa  86.3  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000771093 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1739  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.19 
 
 		 204 aa  85.1  9e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.749284  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2621  cobalt transport protein CbiM  27.83 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.78373  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2184  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.66 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00256059 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0062  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.5 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000311798  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1370  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.51 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.711039  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0330  cobalt transport protein CbiM  27.27 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0772  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.38 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0519153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1863  cobalt transport protein CbiM  32.89 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.292788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0298  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.14 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.306858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.38 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1057  cobalt transport protein CbiM  31.79 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0391  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.27 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.026574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.24 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2565  cobalt transport protein CbiM  32.12 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.779557  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1450  cobalt transport protein CbiM  34.38 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.208192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1402  cobalt transport protein CbiM  33.33 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0192  cobalt transport protein CbiM  31.71 
 
 		 230 aa  72  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0108763  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2567  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.91 
 
 		 216 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.29234  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0213  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.27 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.655003  normal  0.171707 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1148  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.93 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00870535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0174  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.15 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.801433  normal  0.632766 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11090  cobalt transport protein CbiM  25.56 
 
 		 339 aa  68.9  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000340042  normal  0.0123253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1044  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  23.21 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.116161 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.39 
 
 		 310 aa  67  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118647  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4293  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.74 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1927  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.58 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2033  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.77 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2291  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  25.22 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.372139 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.29 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2063  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.71 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2109  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.71 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494306  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2046  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.71 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4058  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.4 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.815174  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>