96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1133 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1133  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  100 
 
 		 198 aa  382  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.540876 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1346  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  69.39 
 
 		 198 aa  241  7e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0137458  unclonable  0.00000105881 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3139  cobalt transport protein CbiM  53.57 
 
 		 204 aa  189  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2022  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  48.98 
 
 		 197 aa  188  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000920884  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3138  cobalt transport protein CbiM  47.96 
 
 		 208 aa  169  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1190  cobalt transport protein CbiM  46.43 
 
 		 204 aa  168  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000465772  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1959  cobalt transport protein CbiM  40.82 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0756  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  41.03 
 
 		 204 aa  159  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.535261  normal  0.785347 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3500  cobalt transport protein CbiM  43.72 
 
 		 211 aa  157  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3436  cobalt transport protein CbiM  40 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.790482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1951  cobalt transport protein CbiM  43.88 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2093  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  44.39 
 
 		 201 aa  144  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00179951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1936  cobalt transport protein CbiM  52.04 
 
 		 204 aa  144  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0543  cobalt transport protein CbiM  43.65 
 
 		 193 aa  141  6e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0171  cobalt transport protein CbiM  44.39 
 
 		 194 aa  135  4e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3140  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  39.09 
 
 		 430 aa  132  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00188953  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3207  cobalt transport protein CbiM  41.21 
 
 		 205 aa  131  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.268984  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1365  cobalt transport protein CbiM  37.5 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1321  cobalt transport protein CbiM  37.5 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0557  cobalt transport protein CbiM  41.71 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.583466  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1471  cobalt transport protein CbiM  44.95 
 
 		 207 aa  118  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.699456  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3947  cobalt transport protein CbiM  39.9 
 
 		 205 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2782  cobalt transport protein CbiM  38.32 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104857  decreased coverage  0.00186647 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2474  cobalt transport protein CbiM  32 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2131  cobalt transport protein CbiM  35.05 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0273  cobalt transport protein CbiM  34 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.163023  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1292  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.57 
 
 		 299 aa  64.7  0.0000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.46518  normal  0.800906 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0090  cobalt transport protein CbiM  25.73 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1739  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.36 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.749284  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0062  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.73 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000311798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3808  cobalt transport protein CbiM  30.41 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.14 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3892  cobalt transport protein CbiM  30.41 
 
 		 256 aa  58.2  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.885543 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1351  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.44 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.309906  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3004  cobalt transport protein CbiM  27.7 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1085  hypothetical protein  32.08 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0031  cobalt transport protein CbiM  25.6 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1148  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.73 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00870535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0391  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.79 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.026574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1193  cobalt transport protein CbiM  30.19 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0712  cobalamin biosynthesis protein CbiM  31.34 
 
 		 235 aa  52.4  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1073  hypothetical protein  28 
 
 		 599 aa  52  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2567  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.94 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.29234  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4058  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.24 
 
 		 235 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.815174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0097  cobalt transport protein CbiM  30.48 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1569  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.68 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.51 
 
 		 328 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2333  cobalt transport protein CbiM  26.51 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0174  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.38 
 
 		 326 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.801433  normal  0.632766 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1327  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.67 
 
 		 229 aa  49.3  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.871033  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0192  cobalt transport protein CbiM  26.94 
 
 		 230 aa  49.3  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0108763  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0725  cobalt transport protein CbiM  30 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.145999 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1766  cobalt transport protein CbiM  24.76 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1545  cobalt transport protein CbiM  29.72 
 
 		 246 aa  48.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221341  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1044  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  25.24 
 
 		 246 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.116161 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2621  cobalt transport protein CbiM  24.76 
 
 		 214 aa  48.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.78373  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0512  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.05 
 
 		 343 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.21192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2291  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.61 
 
 		 235 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.372139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4182  cobalt transport protein CbiM  24.3 
 
 		 251 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2731  cobalamin biosynthesis protein CbiM  29.44 
 
 		 250 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.480074  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1780  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.67 
 
 		 307 aa  47  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347196  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3660  cobalt transport protein CbiM  38.46 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1929  ABC-type Co2+ transport system permease component-like protein  29.77 
 
 		 259 aa  46.6  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.88224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0790  cobalt transport protein CbiM  27.27 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2134  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.23 
 
 		 261 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0772  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.17 
 
 		 241 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0519153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.17 
 
 		 241 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0580  cobalt transport protein CbiM  27.98 
 
 		 229 aa  46.2  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0213  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.79 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.655003  normal  0.171707 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1637  cobalt transport protein CbiM  27.11 
 
 		 242 aa  45.4  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000771093 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2184  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  25.24 
 
 		 241 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00256059 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6032  membrane protein  26.54 
 
 		 217 aa  45.1  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1293  cobalamin biosynthesis protein CbiM  25.81 
 
 		 232 aa  44.7  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034572  normal  0.0275766 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0137  cobalt transport protein CbiM  23.44 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0440058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2046  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.48 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2063  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.48 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2109  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.48 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494306  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1697  cobalt transport protein CbiM  28.64 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.30926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1927  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.04 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0531  cobalt transport protein CbiM  27.48 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1959  cobalt transport protein CbiM  24.89 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0472  cobalt transport protein CbiM  27.31 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2565  cobalt transport protein CbiM  29.63 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.779557  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1755  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.23 
 
 		 306 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1793  cobalt transport protein CbiM  25.15 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000128429  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0323  cobalt transport protein CbiM  30.37 
 
 		 249 aa  42.4  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00019504  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0681  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  25 
 
 		 333 aa  42  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.6 
 
 		 229 aa  42  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0298  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  23.04 
 
 		 213 aa  41.6  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.306858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1370  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.71 
 
 		 232 aa  42  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.711039  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2620  cobalt transport protein CbiM  27.88 
 
 		 247 aa  41.6  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2002  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.13 
 
 		 355 aa  41.6  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3837300000000002e-24 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1279  cobalamin biosynthesis protein CbiM, putative  25.71 
 
 		 343 aa  41.6  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0499926  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.09 
 
 		 310 aa  41.2  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118647  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2033  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.7 
 
 		 217 aa  41.2  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1241  cobalt transport protein CbiM  35.9 
 
 		 226 aa  41.2  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.335474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>