33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6032 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6032  membrane protein  100 
 
 		 217 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0076  hypothetical protein  48.28 
 
 		 222 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3736  hypothetical protein  50.75 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5823  hypothetical protein  36.42 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.91491  normal  0.632902 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0458  hypothetical protein  34.34 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0420  hypothetical protein  32.73 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.359367  normal  0.60264 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3565  hypothetical protein  30.73 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0637619 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4335  hypothetical protein  33.14 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0735993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1388  hypothetical protein  26.85 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.2523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3923  hypothetical protein  33.13 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1013  hypothetical protein  36.97 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4390  hypothetical protein  32.7 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2022  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.73 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000920884  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1959  cobalt transport protein CbiM  34.67 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3186  hypothetical protein  34.34 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3138  cobalt transport protein CbiM  31.55 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3139  cobalt transport protein CbiM  29.56 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3140  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.33 
 
 		 430 aa  51.6  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00188953  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0756  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.44 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.535261  normal  0.785347 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2782  cobalt transport protein CbiM  28.04 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104857  decreased coverage  0.00186647 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3752  hypothetical protein  31.28 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1959  cobalt transport protein CbiM  28.85 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3436  cobalt transport protein CbiM  33.55 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.790482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1739  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.26 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.749284  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0192  cobalt transport protein CbiM  31.16 
 
 		 230 aa  45.4  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0108763  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3500  cobalt transport protein CbiM  31.4 
 
 		 211 aa  45.4  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0557  cobalt transport protein CbiM  31.15 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.583466  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1936  cobalt transport protein CbiM  31.29 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1190  cobalt transport protein CbiM  31.52 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000465772  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1321  cobalt transport protein CbiM  29.21 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1365  cobalt transport protein CbiM  29.21 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1370  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.5 
 
 		 232 aa  42  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.711039  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1450  cobalt transport protein CbiM  29.82 
 
 		 226 aa  41.6  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.208192  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>