14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3186 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3186  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3923  hypothetical protein  99.11 
 
 		 225 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3565  hypothetical protein  81.33 
 
 		 225 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0637619 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4335  hypothetical protein  80 
 
 		 225 aa  334  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0735993 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0458  hypothetical protein  67.56 
 
 		 225 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0420  hypothetical protein  69.78 
 
 		 225 aa  293  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.359367  normal  0.60264 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1388  hypothetical protein  61.54 
 
 		 223 aa  271  8.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.2523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5823  hypothetical protein  62.67 
 
 		 225 aa  268  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.91491  normal  0.632902 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3752  hypothetical protein  63.72 
 
 		 227 aa  237  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4390  hypothetical protein  66.67 
 
 		 182 aa  219  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1013  hypothetical protein  62.9 
 
 		 225 aa  214  8e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6032  membrane protein  34.34 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0076  hypothetical protein  31.34 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3736  hypothetical protein  36.59 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>