14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3565 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3565  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  434  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0637619 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4335  hypothetical protein  88.44 
 
 
225 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0735993 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0420  hypothetical protein  74.67 
 
 
225 aa  313  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.359367  normal  0.60264 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0458  hypothetical protein  71.11 
 
 
225 aa  310  7.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3923  hypothetical protein  80.89 
 
 
225 aa  309  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1388  hypothetical protein  65.02 
 
 
223 aa  288  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.2523  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3186  hypothetical protein  81.33 
 
 
225 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5823  hypothetical protein  63.56 
 
 
225 aa  269  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.91491  normal  0.632902 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3752  hypothetical protein  66.81 
 
 
227 aa  250  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4390  hypothetical protein  66.85 
 
 
182 aa  219  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1013  hypothetical protein  67.18 
 
 
225 aa  215  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0076  hypothetical protein  32.86 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6032  membrane protein  29.91 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3736  hypothetical protein  36.74 
 
 
212 aa  56.2  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>