17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0076 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0076  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6032  membrane protein  48.28 
 
 
217 aa  178  7e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3736  hypothetical protein  62.11 
 
 
212 aa  148  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3565  hypothetical protein  34.12 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0637619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5823  hypothetical protein  31.48 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.91491  normal  0.632902 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0458  hypothetical protein  30.8 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4335  hypothetical protein  33.54 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0735993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1388  hypothetical protein  30.09 
 
 
223 aa  72  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.2523  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0420  hypothetical protein  33 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.359367  normal  0.60264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4390  hypothetical protein  34.81 
 
 
182 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3923  hypothetical protein  29.74 
 
 
225 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1959  cobalt transport protein CbiM  31.53 
 
 
208 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0756  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.76 
 
 
204 aa  46.2  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.535261  normal  0.785347 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3436  cobalt transport protein CbiM  32.47 
 
 
203 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.790482  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1013  hypothetical protein  29.82 
 
 
225 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3752  hypothetical protein  30.48 
 
 
227 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3186  hypothetical protein  30.26 
 
 
225 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>