16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0458 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0458  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  442  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0420  hypothetical protein  86.67 
 
 		 225 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.359367  normal  0.60264 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3565  hypothetical protein  71.11 
 
 		 225 aa  310  7.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0637619 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4335  hypothetical protein  71.11 
 
 		 225 aa  309  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0735993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1388  hypothetical protein  64.13 
 
 		 223 aa  293  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.2523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5823  hypothetical protein  67.56 
 
 		 225 aa  285  4e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.91491  normal  0.632902 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3923  hypothetical protein  67.11 
 
 		 225 aa  268  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3752  hypothetical protein  67.26 
 
 		 227 aa  257  8e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3186  hypothetical protein  67.56 
 
 		 225 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1013  hypothetical protein  66.67 
 
 		 225 aa  229  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4390  hypothetical protein  67.4 
 
 		 182 aa  218  8.999999999999998e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6032  membrane protein  34.34 
 
 		 217 aa  81.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0076  hypothetical protein  31.25 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3736  hypothetical protein  36.49 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0756  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.36 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.535261  normal  0.785347 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3140  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  39.29 
 
 		 430 aa  43.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00188953  normal  0.574819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>