14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3923 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3923  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3186  hypothetical protein  99.11 
 
 
225 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3565  hypothetical protein  80.89 
 
 
225 aa  348  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0637619 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4335  hypothetical protein  79.56 
 
 
225 aa  332  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0735993 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0458  hypothetical protein  67.11 
 
 
225 aa  300  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0420  hypothetical protein  69.33 
 
 
225 aa  290  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.359367  normal  0.60264 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1388  hypothetical protein  61.54 
 
 
223 aa  271  6e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.2523  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5823  hypothetical protein  62.67 
 
 
225 aa  266  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.91491  normal  0.632902 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3752  hypothetical protein  63.72 
 
 
227 aa  237  9e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4390  hypothetical protein  66.11 
 
 
182 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1013  hypothetical protein  62.44 
 
 
225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6032  membrane protein  33.13 
 
 
217 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0076  hypothetical protein  30.85 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3736  hypothetical protein  35.61 
 
 
212 aa  55.8  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>