105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3947 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3947  cobalt transport protein CbiM  100 
 
 
205 aa  370  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3207  cobalt transport protein CbiM  96.1 
 
 
205 aa  331  6e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.268984  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1365  cobalt transport protein CbiM  56.72 
 
 
211 aa  180  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1321  cobalt transport protein CbiM  56.72 
 
 
211 aa  180  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1959  cobalt transport protein CbiM  49 
 
 
208 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2022  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  46.31 
 
 
197 aa  156  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000920884  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1951  cobalt transport protein CbiM  51.5 
 
 
211 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70301  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3436  cobalt transport protein CbiM  47.26 
 
 
203 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.790482  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3140  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  49.75 
 
 
430 aa  152  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00188953  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2093  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  46.73 
 
 
201 aa  149  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00179951  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0756  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  45.32 
 
 
204 aa  143  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.535261  normal  0.785347 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3500  cobalt transport protein CbiM  47.34 
 
 
211 aa  140  9e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3139  cobalt transport protein CbiM  50 
 
 
204 aa  139  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3138  cobalt transport protein CbiM  42.71 
 
 
208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1190  cobalt transport protein CbiM  46.08 
 
 
204 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000465772  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1346  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  41.21 
 
 
198 aa  128  6e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0137458  unclonable  0.00000105881 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1133  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  39.9 
 
 
198 aa  122  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.540876 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2474  cobalt transport protein CbiM  36.1 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1471  cobalt transport protein CbiM  45.27 
 
 
207 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.699456  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1936  cobalt transport protein CbiM  47.52 
 
 
204 aa  101  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0171  cobalt transport protein CbiM  35.68 
 
 
194 aa  97.8  8e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0543  cobalt transport protein CbiM  35 
 
 
193 aa  97.1  1e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0557  cobalt transport protein CbiM  36.36 
 
 
195 aa  97.1  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.583466  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2782  cobalt transport protein CbiM  33.02 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104857  decreased coverage  0.00186647 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2131  cobalt transport protein CbiM  46.15 
 
 
197 aa  77  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.08 
 
 
328 aa  72  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0512  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  40.77 
 
 
343 aa  68.9  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.21192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0174  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.13 
 
 
326 aa  68.2  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.801433  normal  0.632766 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0273  cobalt transport protein CbiM  36.87 
 
 
231 aa  67  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.163023  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2134  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  41.48 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1755  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.17 
 
 
306 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379762  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1351  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  39.34 
 
 
233 aa  63.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.309906  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2063  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.76 
 
 
232 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2109  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.76 
 
 
232 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494306  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2046  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.76 
 
 
232 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1044  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.62 
 
 
246 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.116161 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1927  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.59 
 
 
242 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2184  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.59 
 
 
241 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00256059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2291  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.56 
 
 
235 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.372139 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2567  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.45 
 
 
216 aa  58.5  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.29234  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4182  cobalt transport protein CbiM  33.03 
 
 
251 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.84 
 
 
229 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0391  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.64 
 
 
202 aa  56.2  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.026574  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4058  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.43 
 
 
235 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.815174  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.08 
 
 
241 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0772  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.08 
 
 
241 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0519153  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1148  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.15 
 
 
218 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00870535  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0062  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.77 
 
 
213 aa  55.1  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000311798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3808  cobalt transport protein CbiM  31.94 
 
 
245 aa  54.3  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0298  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.13 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.306858  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0882  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.76 
 
 
421 aa  54.3  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4293  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.81 
 
 
230 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1780  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.31 
 
 
307 aa  53.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347196  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1292  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.15 
 
 
299 aa  52.4  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.46518  normal  0.800906 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1116  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36 
 
 
238 aa  52  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.58 
 
 
202 aa  51.2  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3004  cobalt transport protein CbiM  30.05 
 
 
321 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2352  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.08 
 
 
310 aa  50.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1480  cobalt transport protein CbiM  34.96 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1085  hypothetical protein  28.84 
 
 
231 aa  50.8  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1569  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.75 
 
 
233 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0192  cobalt transport protein CbiM  33.9 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0108763  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3892  cobalt transport protein CbiM  32.09 
 
 
256 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.885543 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1450  cobalt transport protein CbiM  37.93 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.208192  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2621  cobalt transport protein CbiM  34.46 
 
 
214 aa  49.7  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.78373  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0790  cobalt transport protein CbiM  29.89 
 
 
225 aa  48.9  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2752  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.18 
 
 
354 aa  48.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1959  cobalt transport protein CbiM  29.55 
 
 
226 aa  48.1  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0472  cobalt transport protein CbiM  32.11 
 
 
225 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0213  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.17 
 
 
202 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.655003  normal  0.171707 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2801  ABC type permease  35.56 
 
 
225 aa  47.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2305  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.92 
 
 
210 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1006  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.59 
 
 
238 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154415  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1193  cobalt transport protein CbiM  29.63 
 
 
225 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1929  ABC-type Co2+ transport system permease component-like protein  34.35 
 
 
259 aa  47.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.88224  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2565  cobalt transport protein CbiM  33.88 
 
 
239 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.779557  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1793  cobalt transport protein CbiM  28.67 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000128429  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0097  cobalt transport protein CbiM  29.63 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0725  cobalt transport protein CbiM  29.17 
 
 
225 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.145999 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1637  cobalt transport protein CbiM  33.61 
 
 
242 aa  46.6  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000771093 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1182  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.86 
 
 
331 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00505251  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1370  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.17 
 
 
232 aa  47  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.711039  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1739  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.77 
 
 
204 aa  46.6  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.749284  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1003  cobalamin biosynthesis protein CbiM  28.57 
 
 
236 aa  46.2  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1073  hypothetical protein  26.43 
 
 
599 aa  45.8  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3205  cobalt transport protein CbiM  26.29 
 
 
229 aa  45.4  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0681  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.85 
 
 
333 aa  45.4  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1057  cobalt transport protein CbiM  27.35 
 
 
330 aa  45.1  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0031  cobalt transport protein CbiM  24.06 
 
 
212 aa  45.1  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1803  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.35 
 
 
352 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1767  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.93 
 
 
219 aa  44.3  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.113369  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2333  cobalt transport protein CbiM  23.43 
 
 
235 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0780  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.77 
 
 
348 aa  43.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000017293  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0531  cobalt transport protein CbiM  26.54 
 
 
230 aa  42.7  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0137  cobalt transport protein CbiM  26 
 
 
212 aa  42.7  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0440058 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2033  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.78 
 
 
217 aa  42.4  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6032  membrane protein  37.5 
 
 
217 aa  42.4  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0993  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  40 
 
 
344 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1766  cobalt transport protein CbiM  26.67 
 
 
212 aa  42  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1863  cobalt transport protein CbiM  31.3 
 
 
352 aa  41.6  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.292788  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>