151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0531 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0531  cobalt transport protein CbiM  100 
 
 
230 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1700  cobalt transport protein CbiM  62.88 
 
 
231 aa  295  5e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000112913  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2145  cobalt transport protein CbiM  62.34 
 
 
235 aa  293  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0808457  normal  0.37009 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1702  cobalamin biosynthesis protein CbiM  62.45 
 
 
231 aa  291  5e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.254913  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0580  cobalt transport protein CbiM  66.09 
 
 
229 aa  285  5e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2333  cobalt transport protein CbiM  58.52 
 
 
235 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1216  cobalt transport protein CbiM  58.44 
 
 
231 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3205  cobalt transport protein CbiM  56.83 
 
 
229 aa  271  7e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1293  cobalamin biosynthesis protein CbiM  59.39 
 
 
232 aa  269  2e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034572  normal  0.0275766 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1085  hypothetical protein  58.7 
 
 
231 aa  260  1e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0323  cobalt transport protein CbiM  57.01 
 
 
249 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00019504  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0790  cobalt transport protein CbiM  55.96 
 
 
225 aa  237  1e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0725  cobalt transport protein CbiM  54.26 
 
 
225 aa  237  1e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.145999 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1073  hypothetical protein  52.81 
 
 
599 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1193  cobalt transport protein CbiM  53.81 
 
 
225 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0097  cobalt transport protein CbiM  52.42 
 
 
225 aa  232  3e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0560  cobalamin biosynthesis protein CbiM  60.4 
 
 
249 aa  228  6e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1060  cobalt transport protein CbiM  54.26 
 
 
254 aa  226  3e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1276  cobalamin biosynthesis protein CbiM  59.31 
 
 
246 aa  224  7e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0185  cobalt transport protein CbiM  53.64 
 
 
247 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.878644  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0182  cobalt transport protein CbiM  53.18 
 
 
247 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2601  cobalt transport protein CbiM  52.94 
 
 
246 aa  221  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.184682  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3736  cobalamin biosynthesis protein CbiM  53.85 
 
 
251 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0927  cobalamin biosynthesis protein CbiM  53.54 
 
 
250 aa  220  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326506  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3660  cobalt transport protein CbiM  55.76 
 
 
225 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0146  cobalt transport protein CbiM  54.03 
 
 
221 aa  219  3e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0185688  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1385  cobalamin biosynthesis protein CbiM  55 
 
 
250 aa  218  5e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2620  cobalt transport protein CbiM  53.92 
 
 
247 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2731  cobalamin biosynthesis protein CbiM  54.98 
 
 
250 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.480074  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1697  cobalt transport protein CbiM  51.34 
 
 
225 aa  217  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.30926 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1545  cobalt transport protein CbiM  54.17 
 
 
246 aa  217  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221341  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0712  cobalamin biosynthesis protein CbiM  55.56 
 
 
235 aa  216  2e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1759  cobalt transport protein CbiM  54.75 
 
 
228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2145  cobalt transport protein CbiM  52.58 
 
 
245 aa  211  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2245  cobalt transport protein CbiM  52.58 
 
 
245 aa  211  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.112187 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2358  cobalt transport protein CbiM  52.58 
 
 
245 aa  211  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.372857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2199  cobalt transport protein CbiM  52.58 
 
 
245 aa  211  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2192  cobalt transport protein CbiM  52.58 
 
 
245 aa  211  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1266  cobalamin biosynthesis protein CbiM  48.61 
 
 
248 aa  208  5e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1241  cobalt transport protein CbiM  50.66 
 
 
226 aa  208  6e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.335474  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1226  cobalt transport protein CbiM  50.66 
 
 
226 aa  207  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00004415  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2793  cobalt transport protein CbiM  53.39 
 
 
226 aa  206  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132935  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3820  cobalt transport protein CbiM  56.86 
 
 
249 aa  203  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1003  cobalamin biosynthesis protein CbiM  52.86 
 
 
236 aa  202  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2595  cobalt transport protein CbiM  54.59 
 
 
226 aa  202  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0918235  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1222  cobalt transport protein CbiM  48 
 
 
234 aa  200  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.955789  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0543  cobalamin biosynthesis protein CbiM  52.25 
 
 
226 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1709  cobalamin biosynthesis protein CbiM  48.44 
 
 
248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4719  cobalamin biosynthesis protein CbiM  54.13 
 
 
225 aa  191  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1861  cobalamin biosynthesis protein CbiM  52.75 
 
 
224 aa  190  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0380  hypothetical protein  49.78 
 
 
259 aa  190  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3589  cobalamin biosynthesis protein CbiM  51.98 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3892  cobalt transport protein CbiM  39.29 
 
 
256 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.885543 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3808  cobalt transport protein CbiM  38.91 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3004  cobalt transport protein CbiM  37.9 
 
 
321 aa  161  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4182  cobalt transport protein CbiM  38.22 
 
 
251 aa  151  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0472  cobalt transport protein CbiM  37.67 
 
 
225 aa  146  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1766  cobalt transport protein CbiM  33.78 
 
 
212 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0137  cobalt transport protein CbiM  32.43 
 
 
212 aa  96.7  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0440058 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0031  cobalt transport protein CbiM  31.48 
 
 
212 aa  94.4  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0090  cobalt transport protein CbiM  34.22 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2184  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30 
 
 
241 aa  91.7  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00256059 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1480  cobalt transport protein CbiM  29.11 
 
 
213 aa  86.7  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2621  cobalt transport protein CbiM  32.24 
 
 
214 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.78373  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1767  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.76 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.113369  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1044  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.91 
 
 
246 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.116161 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2565  cobalt transport protein CbiM  34.9 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.779557  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1637  cobalt transport protein CbiM  38.26 
 
 
242 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000771093 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0298  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.306858  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1402  cobalt transport protein CbiM  33.18 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0882  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.77 
 
 
421 aa  73.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1959  cobalt transport protein CbiM  31.34 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1739  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.86 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.749284  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2291  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.22 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.372139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4058  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.7 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.815174  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1057  cobalt transport protein CbiM  34.11 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0512  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.48 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.21192 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2567  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.37 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.29234  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.64 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0772  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.64 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0519153  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1793  cobalt transport protein CbiM  27.98 
 
 
218 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000128429  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1148  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.73 
 
 
218 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00870535  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1863  cobalt transport protein CbiM  33.59 
 
 
352 aa  67  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.292788  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0192  cobalt transport protein CbiM  31.25 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0108763  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1370  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.77 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.711039  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4293  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.21 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.19 
 
 
328 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1450  cobalt transport protein CbiM  32.03 
 
 
226 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.208192  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.69 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1927  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.75 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.64 
 
 
310 aa  64.3  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118647  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1006  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.98 
 
 
238 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154415  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2063  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.66 
 
 
232 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2109  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.66 
 
 
232 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494306  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1803  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  25.73 
 
 
352 aa  62.4  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2046  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.66 
 
 
232 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2352  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.96 
 
 
310 aa  60.5  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0330  cobalt transport protein CbiM  25.85 
 
 
325 aa  59.3  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0174  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.52 
 
 
326 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.801433  normal  0.632766 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11090  cobalt transport protein CbiM  31.01 
 
 
339 aa  57.8  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000340042  normal  0.0123253 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>