152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1471 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1471  cobalt transport protein CbiM  100 
 
 
207 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.699456  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3138  cobalt transport protein CbiM  63.9 
 
 
208 aa  247  8e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1190  cobalt transport protein CbiM  62.44 
 
 
204 aa  229  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000465772  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3139  cobalt transport protein CbiM  62.56 
 
 
204 aa  221  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0756  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  51.46 
 
 
204 aa  193  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.535261  normal  0.785347 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2022  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  52.26 
 
 
197 aa  192  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000920884  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3500  cobalt transport protein CbiM  53.03 
 
 
211 aa  184  9e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1959  cobalt transport protein CbiM  47 
 
 
208 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1951  cobalt transport protein CbiM  53.5 
 
 
211 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70301  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3436  cobalt transport protein CbiM  48.76 
 
 
203 aa  168  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.790482  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1936  cobalt transport protein CbiM  59.42 
 
 
204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3140  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  48.73 
 
 
430 aa  154  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00188953  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2093  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  45.73 
 
 
201 aa  153  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00179951  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1365  cobalt transport protein CbiM  46.19 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1321  cobalt transport protein CbiM  46.19 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1346  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  43.84 
 
 
198 aa  137  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0137458  unclonable  0.00000105881 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1133  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  44.95 
 
 
198 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.540876 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3207  cobalt transport protein CbiM  43.72 
 
 
205 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.268984  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0171  cobalt transport protein CbiM  39.5 
 
 
194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0543  cobalt transport protein CbiM  37 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2474  cobalt transport protein CbiM  33.82 
 
 
201 aa  112  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3947  cobalt transport protein CbiM  46.77 
 
 
205 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0557  cobalt transport protein CbiM  37.44 
 
 
195 aa  106  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.583466  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2782  cobalt transport protein CbiM  36.28 
 
 
214 aa  93.6  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104857  decreased coverage  0.00186647 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.8 
 
 
328 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2752  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.33 
 
 
354 aa  77  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1044  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.42 
 
 
246 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.116161 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2184  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.12 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00256059 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2131  cobalt transport protein CbiM  32.67 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1085  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1200  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.79 
 
 
347 aa  71.6  0.000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.028093  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4182  cobalt transport protein CbiM  34.42 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3004  cobalt transport protein CbiM  33.02 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1351  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.08 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.309906  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3808  cobalt transport protein CbiM  32.44 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0298  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.02 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.306858  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3892  cobalt transport protein CbiM  33.62 
 
 
256 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.885543 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0681  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.81 
 
 
333 aa  68.2  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0273  cobalt transport protein CbiM  36.23 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.163023  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0780  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.33 
 
 
348 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000017293  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0174  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.56 
 
 
326 aa  65.5  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.801433  normal  0.632766 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2567  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.79 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.29234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1279  cobalamin biosynthesis protein CbiM, putative  35.05 
 
 
343 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0499926  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1073  hypothetical protein  27.43 
 
 
599 aa  64.3  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0062  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.85 
 
 
213 aa  63.5  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000311798  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.55 
 
 
241 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1003  cobalamin biosynthesis protein CbiM  30.99 
 
 
236 aa  63.2  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0772  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.55 
 
 
241 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0519153  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1803  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.96 
 
 
352 aa  62  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2762  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.72 
 
 
348 aa  62  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.95 
 
 
229 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1755  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.49 
 
 
306 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379762  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2002  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.68 
 
 
355 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3837300000000002e-24 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0330  cobalt transport protein CbiM  30.04 
 
 
325 aa  60.1  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0531  cobalt transport protein CbiM  32.58 
 
 
230 aa  60.1  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0192  cobalt transport protein CbiM  30.45 
 
 
230 aa  60.1  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0108763  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2731  cobalamin biosynthesis protein CbiM  28.44 
 
 
250 aa  58.9  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.480074  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0712  cobalamin biosynthesis protein CbiM  31.63 
 
 
235 aa  58.9  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0927  cobalamin biosynthesis protein CbiM  32.73 
 
 
250 aa  58.2  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326506  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0882  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.25 
 
 
421 aa  58.2  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11090  cobalt transport protein CbiM  27.66 
 
 
339 aa  58.2  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000340042  normal  0.0123253 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1450  cobalt transport protein CbiM  34.72 
 
 
226 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.208192  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1766  cobalt transport protein CbiM  29.19 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1276  cobalamin biosynthesis protein CbiM  31.22 
 
 
246 aa  57.8  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1739  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.54 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.749284  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0380  hypothetical protein  35.91 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1697  cobalt transport protein CbiM  31.82 
 
 
225 aa  55.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.30926 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0512  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.02 
 
 
343 aa  56.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.21192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2793  cobalt transport protein CbiM  31.51 
 
 
226 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132935  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0031  cobalt transport protein CbiM  25.69 
 
 
212 aa  55.5  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1702  cobalamin biosynthesis protein CbiM  28.77 
 
 
231 aa  55.5  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.254913  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1385  cobalamin biosynthesis protein CbiM  29.87 
 
 
250 aa  55.5  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1863  cobalt transport protein CbiM  32.44 
 
 
352 aa  55.1  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.292788  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0560  cobalamin biosynthesis protein CbiM  31.58 
 
 
249 aa  55.1  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1327  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.38 
 
 
229 aa  55.1  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.871033  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1959  cobalt transport protein CbiM  26.36 
 
 
226 aa  54.3  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2333  cobalt transport protein CbiM  27.91 
 
 
235 aa  54.3  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2595  cobalt transport protein CbiM  32.42 
 
 
226 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0918235  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0323  cobalt transport protein CbiM  31 
 
 
249 aa  53.9  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00019504  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0790  cobalt transport protein CbiM  28.9 
 
 
225 aa  53.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0137  cobalt transport protein CbiM  28.11 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0440058 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1148  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.41 
 
 
218 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00870535  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1767  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.34 
 
 
219 aa  52.8  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.113369  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0472  cobalt transport protein CbiM  32.87 
 
 
225 aa  53.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2225  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.34 
 
 
359 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000325574  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.05 
 
 
310 aa  52  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118647  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3589  cobalamin biosynthesis protein CbiM  33.99 
 
 
232 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1292  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.14 
 
 
299 aa  51.6  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.46518  normal  0.800906 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1805  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.49 
 
 
341 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000423856  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6032  membrane protein  31.78 
 
 
217 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1057  cobalt transport protein CbiM  33.57 
 
 
330 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3205  cobalt transport protein CbiM  25.99 
 
 
229 aa  50.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4058  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.25 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.815174  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1006  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.33 
 
 
238 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154415  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2352  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.84 
 
 
310 aa  49.7  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1243  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.86 
 
 
233 aa  49.7  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000323865  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0090  cobalt transport protein CbiM  26.05 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0580  cobalt transport protein CbiM  29.49 
 
 
229 aa  49.3  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.54 
 
 
202 aa  49.3  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1060  cobalt transport protein CbiM  32.57 
 
 
254 aa  48.9  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>