74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2292 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2292  ribonuclease T2  100 
 
 		 212 aa  442  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.62004  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2192  ribonuclease T2  66.67 
 
 		 213 aa  300  8.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.381743  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3807  ribonuclease T2  58.9 
 
 		 219 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290686 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2529  ribonuclease T2  38.99 
 
 		 229 aa  158  5e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4864  ribonuclease T2  36.89 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158338  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3150  ribonuclease T2  38.36 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1400  ribonuclease T2  38.67 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.338332  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4041  ribonuclease T2  36.44 
 
 		 230 aa  144  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.107175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1732  putative ribonuclease T2 family protein  35.09 
 
 		 233 aa  142  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.370011 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1972  ribonuclease T2  37.5 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.715312  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4187  ribonuclease T2  37.32 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2731  ribonuclease T2  38.34 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0880  ribonuclease T2  35.32 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.558243  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0919  ribonuclease T2  35.09 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.46623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0855  ribonuclease T2  37.11 
 
 		 223 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2259  ribonuclease T2  35.23 
 
 		 206 aa  131  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.291915  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1593  ribonuclease T2  39.57 
 
 		 301 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_004310  BR0703  ribonuclease T2 family protein  34.27 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0694  ribonuclease T2 family protein  34.27 
 
 		 229 aa  128  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0786  ribonuclease T2  37.1 
 
 		 252 aa  128  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123523  normal  0.0777088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1499  ribonuclease T2  37.63 
 
 		 216 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0146445  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0660  ribonuclease T2  37.88 
 
 		 238 aa  128  8.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.315761 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2631  ribonuclease T2  33.49 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2266  ribonuclease T2  37.11 
 
 		 224 aa  125  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  0.473207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0680  ribonuclease T2  36.5 
 
 		 200 aa  124  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.767299  normal  0.958161 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2583  ribonuclease T2  33.33 
 
 		 225 aa  122  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2370  ribonuclease T2  33.9 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3879  ribonuclease T2  33 
 
 		 210 aa  118  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111737 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0715  ribonuclease T2  33.33 
 
 		 206 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0516  ribonuclease T2  33.33 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.13199  normal  0.104349 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0254  ribonuclease T2  33.7 
 
 		 213 aa  115  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4717  ribonuclease T2  28.92 
 
 		 232 aa  84.7  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0786884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0224  ribonuclease T2  28.42 
 
 		 233 aa  84.7  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1151  ribonuclease T2  32.43 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.745478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0042  ribonuclease T2  29.09 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.389135  normal  0.181454 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3184  ribonuclease T2  29.03 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0727864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2133  putative ribonuclease I  28.5 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2911  ribonuclease T2  34.23 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0103832  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2621  ribonuclease T2  31.16 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.415394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46550  ribonuclease  23.11 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177193  hitchhiker  0.00000141946 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1293  ribonuclease T2 family protein  31.62 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2881  ribonuclease T2  27.17 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2930  Ribonuclease protein  31.54 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3777  ribonuclease T2  30.05 
 
 		 388 aa  55.5  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3279  ribonuclease T2  24.86 
 
 		 350 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.127933 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3784  ribonuclease T2  27.94 
 
 		 385 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4174  ribonuclease T2  29.1 
 
 		 389 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3984  ribonuclease T2  27.72 
 
 		 385 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_92983  predicted protein  29.57 
 
 		 286 aa  52.4  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.359164  normal  0.0223874 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3857  ribonuclease T2  27.72 
 
 		 385 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2475  ribonuclease T2  28.57 
 
 		 240 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.949724  normal  0.332624 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4104  ribonuclease T2  29.1 
 
 		 389 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3450  ribonuclease T2  31.82 
 
 		 356 aa  51.6  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.854152  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0932  ribonuclease T2 family protein  28.81 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0161  ribonuclease T2  29.1 
 
 		 389 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4599  ribonuclease T2 family protein  26.19 
 
 		 384 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4948  ribonuclease T2  31.01 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198544 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1789  ribonuclease T2 family protein  28.98 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1696  ribonuclease T2  32.48 
 
 		 337 aa  50.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5338  ribonuclease T2  31.01 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0955657 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3420  ribonuclease T2  31.01 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0841  ribonuclease T2 family protein  28.41 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.259651  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2188  ribonuclease T2 family protein  28.41 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3667  ribonuclease T2  31.01 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.672058  normal  0.702219 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4305  ribonuclease T2  28.42 
 
 		 389 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0733  ribonuclease T2  30.38 
 
 		 297 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.26318  normal  0.193962 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2760  hypothetical protein  26.37 
 
 		 326 aa  48.5  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2045  hypothetical protein  23.12 
 
 		 219 aa  48.1  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.610993 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4890  ribonuclease T2  31.14 
 
 		 243 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000220768 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10740  Ribonuclease T2  23.37 
 
 		 331 aa  47.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.411668  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4373  ribonuclease T2  30.82 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1764  hypothetical protein  22.78 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2906  hypothetical protein  28.57 
 
 		 326 aa  45.1  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2118  putative ribonuclease protein  26 
 
 		 256 aa  43.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.336205 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>