82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2760 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2906  hypothetical protein  97.24 
 
 
326 aa  667    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2760  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  682    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1293  ribonuclease T2 family protein  37.76 
 
 
315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3476  ribonuclease T2 family protein  37.23 
 
 
323 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.392074  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3784  ribonuclease T2  34.96 
 
 
385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3984  ribonuclease T2  35.63 
 
 
385 aa  195  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3857  ribonuclease T2  35.33 
 
 
385 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4599  ribonuclease T2 family protein  35.06 
 
 
384 aa  192  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4174  ribonuclease T2  33.99 
 
 
389 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0161  ribonuclease T2  33.71 
 
 
389 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4305  ribonuclease T2  33.43 
 
 
389 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4104  ribonuclease T2  33.43 
 
 
389 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10740  Ribonuclease T2  35.2 
 
 
331 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.411668  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3777  ribonuclease T2  32.39 
 
 
388 aa  178  9e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1696  ribonuclease T2  29.18 
 
 
337 aa  127  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3279  ribonuclease T2  27.93 
 
 
350 aa  119  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.127933 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3450  ribonuclease T2  26.94 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.854152  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2930  Ribonuclease protein  32.65 
 
 
240 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2133  putative ribonuclease I  34.95 
 
 
279 aa  101  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2881  ribonuclease T2  30.98 
 
 
246 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0699  ribonuclease I  32.52 
 
 
268 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0733  ribonuclease T2  36.26 
 
 
297 aa  99  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.26318  normal  0.193962 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00579  ribonuclease I  32.04 
 
 
268 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5338  ribonuclease T2  35.71 
 
 
243 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0955657 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4890  ribonuclease T2  32.52 
 
 
243 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000220768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0662  ribonuclease I  32.04 
 
 
268 aa  99  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3014  Enterobacter ribonuclease  32.04 
 
 
268 aa  99  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00399142  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3033  ribonuclease I  31.71 
 
 
274 aa  99  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0525  ribonuclease I  32.04 
 
 
268 aa  98.6  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0633  ribonuclease I  32.04 
 
 
268 aa  99  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.988067  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4948  ribonuclease T2  35.71 
 
 
243 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3420  ribonuclease T2  35.71 
 
 
243 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00568  hypothetical protein  32.04 
 
 
268 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2621  ribonuclease T2  31.52 
 
 
246 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.415394  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0630  ribonuclease I  32.04 
 
 
268 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3667  ribonuclease T2  35.71 
 
 
243 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.672058  normal  0.702219 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0932  ribonuclease T2 family protein  33.5 
 
 
240 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4373  ribonuclease T2  32.52 
 
 
243 aa  96.3  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2118  putative ribonuclease protein  27.75 
 
 
256 aa  96.3  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.336205 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1789  ribonuclease T2 family protein  35.43 
 
 
240 aa  95.9  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2188  ribonuclease T2 family protein  33.01 
 
 
240 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0841  ribonuclease T2 family protein  33.01 
 
 
240 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.259651  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0671  ribonuclease I  30.5 
 
 
268 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0657  ribonuclease I  30.98 
 
 
268 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0730  ribonuclease I  30.5 
 
 
268 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.33968  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1151  ribonuclease I  30.69 
 
 
269 aa  93.2  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.299247 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0776  ribonuclease I  30 
 
 
268 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.821609  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2911  ribonuclease T2  28.57 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0103832  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0680  ribonuclease T2  27.13 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.767299  normal  0.958161 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2583  ribonuclease T2  29.41 
 
 
225 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1499  ribonuclease T2  27.57 
 
 
216 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0146445  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1732  putative ribonuclease T2 family protein  24.08 
 
 
233 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.370011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0254  ribonuclease T2  27.91 
 
 
213 aa  64.3  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0703  ribonuclease T2 family protein  26.46 
 
 
229 aa  62  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0715  ribonuclease T2  25.89 
 
 
206 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0694  ribonuclease T2 family protein  26.46 
 
 
229 aa  62  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2370  ribonuclease T2  25.89 
 
 
206 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1593  ribonuclease T2  29.1 
 
 
301 aa  62.4  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1972  ribonuclease T2  30.77 
 
 
216 aa  60.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.715312  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2731  ribonuclease T2  32.79 
 
 
220 aa  59.7  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2529  ribonuclease T2  24.19 
 
 
229 aa  59.7  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1400  ribonuclease T2  25 
 
 
232 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.338332  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0516  ribonuclease T2  24.87 
 
 
206 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.13199  normal  0.104349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4864  ribonuclease T2  25.89 
 
 
231 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158338  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3150  ribonuclease T2  24.73 
 
 
230 aa  57.4  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0880  ribonuclease T2  26.2 
 
 
224 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.558243  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0660  ribonuclease T2  27.66 
 
 
238 aa  56.6  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.315761 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0855  ribonuclease T2  25.67 
 
 
223 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0919  ribonuclease T2  25.67 
 
 
224 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.46623  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2631  ribonuclease T2  23.63 
 
 
214 aa  55.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0786  ribonuclease T2  28.95 
 
 
252 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123523  normal  0.0777088 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2259  ribonuclease T2  24.73 
 
 
206 aa  53.9  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.291915  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4187  ribonuclease T2  24.63 
 
 
231 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4041  ribonuclease T2  30.51 
 
 
230 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.107175 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3879  ribonuclease T2  25.27 
 
 
210 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.111737 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2292  ribonuclease T2  26.37 
 
 
212 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.62004  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3807  ribonuclease T2  34.11 
 
 
219 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.290686 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2192  ribonuclease T2  28.91 
 
 
213 aa  46.6  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.381743  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2266  ribonuclease T2  26.34 
 
 
224 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  0.473207 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_92983  predicted protein  27.35 
 
 
286 aa  43.5  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.359164  normal  0.0223874 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0042  ribonuclease T2  26.67 
 
 
239 aa  43.5  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.389135  normal  0.181454 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3184  ribonuclease T2  25.18 
 
 
261 aa  42.7  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0727864  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>