60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0042 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0042  ribonuclease T2  100 
 
 
239 aa  490  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.389135  normal  0.181454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4717  ribonuclease T2  39.81 
 
 
232 aa  155  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0786884  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3184  ribonuclease T2  39.53 
 
 
261 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0727864  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1151  ribonuclease T2  37.61 
 
 
240 aa  132  5e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.745478 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0224  ribonuclease T2  36.32 
 
 
233 aa  128  9.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4041  ribonuclease T2  35.88 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.107175 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4864  ribonuclease T2  35.88 
 
 
231 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158338  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4187  ribonuclease T2  35.88 
 
 
231 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2529  ribonuclease T2  33.53 
 
 
229 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1732  putative ribonuclease T2 family protein  35.5 
 
 
233 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.370011 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1400  ribonuclease T2  33.92 
 
 
232 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.338332  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0786  ribonuclease T2  35.71 
 
 
252 aa  92.8  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123523  normal  0.0777088 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3150  ribonuclease T2  32.94 
 
 
230 aa  92.4  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2731  ribonuclease T2  33.53 
 
 
220 aa  88.6  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3807  ribonuclease T2  33.33 
 
 
219 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.290686 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0660  ribonuclease T2  33.13 
 
 
238 aa  85.9  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.315761 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2192  ribonuclease T2  35.76 
 
 
213 aa  84  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.381743  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0880  ribonuclease T2  31.33 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.558243  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0919  ribonuclease T2  31.33 
 
 
224 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.46623  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0855  ribonuclease T2  33.13 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1972  ribonuclease T2  31.52 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.715312  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0680  ribonuclease T2  32.73 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.767299  normal  0.958161 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2292  ribonuclease T2  29.09 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.62004  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1499  ribonuclease T2  32.74 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0146445  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2583  ribonuclease T2  30.81 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46550  ribonuclease  28.85 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177193  hitchhiker  0.00000141946 
 
 
-
 
NC_004310  BR0703  ribonuclease T2 family protein  30.51 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0694  ribonuclease T2 family protein  30.51 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2631  ribonuclease T2  34.16 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3879  ribonuclease T2  31.76 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.111737 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1593  ribonuclease T2  30.86 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2259  ribonuclease T2  28.92 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.291915  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2266  ribonuclease T2  34.55 
 
 
224 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  0.473207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2911  ribonuclease T2  32.63 
 
 
252 aa  62  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0103832  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0254  ribonuclease T2  30.57 
 
 
213 aa  60.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0516  ribonuclease T2  31.36 
 
 
206 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.13199  normal  0.104349 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2370  ribonuclease T2  30.06 
 
 
206 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2133  putative ribonuclease I  34.17 
 
 
279 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0715  ribonuclease T2  30.06 
 
 
206 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10740  Ribonuclease T2  28.49 
 
 
331 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.411668  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0841  ribonuclease T2 family protein  26.11 
 
 
240 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.259651  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2188  ribonuclease T2 family protein  26.11 
 
 
240 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1789  ribonuclease T2 family protein  26.11 
 
 
240 aa  48.9  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0932  ribonuclease T2 family protein  25.56 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0161  ribonuclease T2  31.11 
 
 
389 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1696  ribonuclease T2  27.61 
 
 
337 aa  48.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3279  ribonuclease T2  28.44 
 
 
350 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.127933 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4174  ribonuclease T2  30.37 
 
 
389 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0733  ribonuclease T2  24.44 
 
 
297 aa  45.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.26318  normal  0.193962 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3420  ribonuclease T2  24.44 
 
 
243 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5338  ribonuclease T2  24.44 
 
 
243 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0955657 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4948  ribonuclease T2  24.44 
 
 
243 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198544 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4890  ribonuclease T2  25 
 
 
243 aa  45.4  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000220768 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3777  ribonuclease T2  27.22 
 
 
388 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3667  ribonuclease T2  24.16 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.672058  normal  0.702219 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4104  ribonuclease T2  29.63 
 
 
389 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2475  ribonuclease T2  28.12 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.949724  normal  0.332624 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4305  ribonuclease T2  29.63 
 
 
389 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4373  ribonuclease T2  24.72 
 
 
243 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2760  hypothetical protein  26.67 
 
 
326 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>