69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3879 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3879  ribonuclease T2  100 
 
 		 210 aa  434  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111737 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2631  ribonuclease T2  64.32 
 
 		 214 aa  276  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0254  ribonuclease T2  63.73 
 
 		 213 aa  270  9e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2259  ribonuclease T2  56.68 
 
 		 206 aa  222  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.291915  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0516  ribonuclease T2  53.97 
 
 		 206 aa  208  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.13199  normal  0.104349 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2370  ribonuclease T2  53.48 
 
 		 206 aa  201  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0715  ribonuclease T2  53.48 
 
 		 206 aa  201  9e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0703  ribonuclease T2 family protein  42.71 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0694  ribonuclease T2 family protein  42.71 
 
 		 229 aa  173  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1499  ribonuclease T2  45.66 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0146445  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0680  ribonuclease T2  48 
 
 		 200 aa  171  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.767299  normal  0.958161 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2583  ribonuclease T2  44.09 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0855  ribonuclease T2  44.71 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1972  ribonuclease T2  41.75 
 
 		 216 aa  155  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.715312  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0880  ribonuclease T2  40.21 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.558243  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1732  putative ribonuclease T2 family protein  36.28 
 
 		 233 aa  154  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.370011 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0919  ribonuclease T2  41.76 
 
 		 224 aa  153  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.46623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2731  ribonuclease T2  38.34 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1400  ribonuclease T2  38.14 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.338332  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1593  ribonuclease T2  42.42 
 
 		 301 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3150  ribonuclease T2  37.04 
 
 		 230 aa  145  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4041  ribonuclease T2  38.86 
 
 		 230 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.107175 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2529  ribonuclease T2  36.74 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0660  ribonuclease T2  42.7 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.315761 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2266  ribonuclease T2  39.42 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  0.473207 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4187  ribonuclease T2  38.65 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2192  ribonuclease T2  37.44 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.381743  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0786  ribonuclease T2  39.25 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123523  normal  0.0777088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3807  ribonuclease T2  38.95 
 
 		 219 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290686 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4864  ribonuclease T2  35.75 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158338  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2292  ribonuclease T2  33 
 
 		 212 aa  118  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.62004  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0224  ribonuclease T2  37.5 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4717  ribonuclease T2  30.23 
 
 		 232 aa  86.7  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0786884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1151  ribonuclease T2  30.29 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.745478 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3184  ribonuclease T2  30.05 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0727864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0042  ribonuclease T2  31.76 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.389135  normal  0.181454 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2133  putative ribonuclease I  31.5 
 
 		 279 aa  65.1  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4104  ribonuclease T2  24.32 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4305  ribonuclease T2  24.32 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4174  ribonuclease T2  23.78 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0161  ribonuclease T2  24.32 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3857  ribonuclease T2  25 
 
 		 385 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3984  ribonuclease T2  23.91 
 
 		 385 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1293  ribonuclease T2 family protein  31.31 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4599  ribonuclease T2 family protein  22.22 
 
 		 384 aa  55.5  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10740  Ribonuclease T2  22.68 
 
 		 331 aa  55.5  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.411668  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3784  ribonuclease T2  24.73 
 
 		 385 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3777  ribonuclease T2  28.57 
 
 		 388 aa  55.1  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3476  ribonuclease T2 family protein  26.11 
 
 		 323 aa  54.7  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.392074  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3279  ribonuclease T2  25 
 
 		 350 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.127933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2881  ribonuclease T2  25.93 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2911  ribonuclease T2  27.83 
 
 		 252 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0103832  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2906  hypothetical protein  26.88 
 
 		 326 aa  51.6  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2760  hypothetical protein  25.27 
 
 		 326 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2621  ribonuclease T2  23.24 
 
 		 246 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.415394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2930  Ribonuclease protein  30.17 
 
 		 240 aa  48.5  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2118  putative ribonuclease protein  29.08 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.336205 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46550  ribonuclease  23.74 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177193  hitchhiker  0.00000141946 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2475  ribonuclease T2  26.96 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.949724  normal  0.332624 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3450  ribonuclease T2  27.88 
 
 		 356 aa  46.2  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.854152  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1696  ribonuclease T2  24.76 
 
 		 337 aa  45.8  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_92983  predicted protein  26.32 
 
 		 286 aa  44.7  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.359164  normal  0.0223874 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0730  ribonuclease I  25.16 
 
 		 268 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.33968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0671  ribonuclease I  25.16 
 
 		 268 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0657  ribonuclease I  25.16 
 
 		 268 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0776  ribonuclease I  25.16 
 
 		 268 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.821609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0699  ribonuclease I  21.82 
 
 		 268 aa  42  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0525  ribonuclease I  21.84 
 
 		 268 aa  42  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0932  ribonuclease T2 family protein  26.32 
 
 		 240 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>