69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1151 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1151  ribonuclease T2  100 
 
 		 240 aa  485  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.745478 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4717  ribonuclease T2  43.84 
 
 		 232 aa  195  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0786884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0224  ribonuclease T2  46.79 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0042  ribonuclease T2  37.67 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.389135  normal  0.181454 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3184  ribonuclease T2  34.3 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0727864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0786  ribonuclease T2  36.99 
 
 		 252 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123523  normal  0.0777088 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2583  ribonuclease T2  34.18 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4864  ribonuclease T2  35.23 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158338  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2266  ribonuclease T2  40.94 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  0.473207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0680  ribonuclease T2  39.18 
 
 		 200 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.767299  normal  0.958161 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4041  ribonuclease T2  34.66 
 
 		 230 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.107175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0855  ribonuclease T2  36.72 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1732  putative ribonuclease T2 family protein  33.91 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.370011 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4187  ribonuclease T2  34.88 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2731  ribonuclease T2  35.94 
 
 		 220 aa  93.2  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0880  ribonuclease T2  36.16 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.558243  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1400  ribonuclease T2  34.66 
 
 		 232 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.338332  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1499  ribonuclease T2  36.59 
 
 		 216 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0146445  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0919  ribonuclease T2  35.59 
 
 		 224 aa  92  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.46623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0694  ribonuclease T2 family protein  32.65 
 
 		 229 aa  92  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0660  ribonuclease T2  32.09 
 
 		 238 aa  91.7  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.315761 
 
 
-
 
NC_004310  BR0703  ribonuclease T2 family protein  32.65 
 
 		 229 aa  91.7  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2529  ribonuclease T2  32.18 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2631  ribonuclease T2  33.72 
 
 		 214 aa  88.2  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3807  ribonuclease T2  31.58 
 
 		 219 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290686 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1972  ribonuclease T2  31.58 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.715312  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1593  ribonuclease T2  36.75 
 
 		 301 aa  85.5  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3150  ribonuclease T2  32.39 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2292  ribonuclease T2  32.43 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.62004  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0254  ribonuclease T2  35.09 
 
 		 213 aa  81.6  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3879  ribonuclease T2  30.29 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111737 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2192  ribonuclease T2  32.75 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.381743  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46550  ribonuclease  29.02 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177193  hitchhiker  0.00000141946 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0516  ribonuclease T2  32.56 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.13199  normal  0.104349 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2370  ribonuclease T2  32.56 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2259  ribonuclease T2  31.03 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.291915  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0715  ribonuclease T2  31.98 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1293  ribonuclease T2 family protein  29.55 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2133  putative ribonuclease I  32.8 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2188  ribonuclease T2 family protein  28.83 
 
 		 240 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0841  ribonuclease T2 family protein  28.83 
 
 		 240 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.259651  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1789  ribonuclease T2 family protein  29.63 
 
 		 240 aa  52.4  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3667  ribonuclease T2  28.66 
 
 		 243 aa  52  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.672058  normal  0.702219 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4890  ribonuclease T2  28.66 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000220768 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5338  ribonuclease T2  29.27 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0955657 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3420  ribonuclease T2  29.27 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0932  ribonuclease T2 family protein  28.83 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4948  ribonuclease T2  29.27 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198544 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0161  ribonuclease T2  27.84 
 
 		 389 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0733  ribonuclease T2  32.81 
 
 		 297 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.26318  normal  0.193962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3279  ribonuclease T2  25.66 
 
 		 350 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.127933 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4373  ribonuclease T2  28.05 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2911  ribonuclease T2  27.01 
 
 		 252 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0103832  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2475  ribonuclease T2  23.58 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.949724  normal  0.332624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10740  Ribonuclease T2  24.77 
 
 		 331 aa  48.9  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.411668  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4104  ribonuclease T2  27.32 
 
 		 389 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4305  ribonuclease T2  27.32 
 
 		 389 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3450  ribonuclease T2  28.37 
 
 		 356 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.854152  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3476  ribonuclease T2 family protein  25.34 
 
 		 323 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.392074  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3784  ribonuclease T2  29.79 
 
 		 385 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3857  ribonuclease T2  27.81 
 
 		 385 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2881  ribonuclease T2  31.06 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4174  ribonuclease T2  26.8 
 
 		 389 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1696  ribonuclease T2  29.03 
 
 		 337 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3984  ribonuclease T2  27.27 
 
 		 385 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4599  ribonuclease T2 family protein  27.04 
 
 		 384 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2621  ribonuclease T2  30.3 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.415394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2118  putative ribonuclease protein  28.57 
 
 		 256 aa  42.4  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.336205 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2930  Ribonuclease protein  25.83 
 
 		 240 aa  42  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>