33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_46550 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_46550  ribonuclease  100 
 
 		 242 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177193  hitchhiker  0.00000141946 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3184  ribonuclease T2  31.94 
 
 		 261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0727864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4717  ribonuclease T2  25.86 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0786884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1151  ribonuclease T2  29.02 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.745478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0042  ribonuclease T2  28.85 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.389135  normal  0.181454 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0224  ribonuclease T2  26.77 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3150  ribonuclease T2  27.04 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2631  ribonuclease T2  30.65 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4187  ribonuclease T2  25.27 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1400  ribonuclease T2  26.7 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.338332  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1732  putative ribonuclease T2 family protein  25.81 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.370011 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2292  ribonuclease T2  23.11 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.62004  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4041  ribonuclease T2  27.74 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.107175 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2259  ribonuclease T2  23.74 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.291915  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2529  ribonuclease T2  26.78 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1972  ribonuclease T2  26.19 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.715312  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2192  ribonuclease T2  25.85 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.381743  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2583  ribonuclease T2  26.28 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4864  ribonuclease T2  27.1 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158338  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2731  ribonuclease T2  23.12 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0703  ribonuclease T2 family protein  23.81 
 
 		 229 aa  53.1  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0694  ribonuclease T2 family protein  23.21 
 
 		 229 aa  52.8  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0660  ribonuclease T2  24.27 
 
 		 238 aa  52  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.315761 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0254  ribonuclease T2  25.12 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3807  ribonuclease T2  23.08 
 
 		 219 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290686 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0786  ribonuclease T2  24.26 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123523  normal  0.0777088 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3879  ribonuclease T2  23.74 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111737 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1499  ribonuclease T2  21.36 
 
 		 216 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0146445  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2370  ribonuclease T2  25.38 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2266  ribonuclease T2  25.62 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  0.473207 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1593  ribonuclease T2  21.28 
 
 		 301 aa  43.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0880  ribonuclease T2  22.93 
 
 		 224 aa  42.4  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.558243  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0680  ribonuclease T2  22.66 
 
 		 200 aa  42  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.767299  normal  0.958161 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>