59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3184 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3184  ribonuclease T2  100 
 
 		 261 aa  536  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0727864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0042  ribonuclease T2  39.57 
 
 		 239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.389135  normal  0.181454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4717  ribonuclease T2  32.76 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0786884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46550  ribonuclease  31.94 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177193  hitchhiker  0.00000141946 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1151  ribonuclease T2  34.3 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.745478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4041  ribonuclease T2  33.04 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.107175 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4187  ribonuclease T2  33.98 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0224  ribonuclease T2  32.73 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4864  ribonuclease T2  31.47 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158338  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2731  ribonuclease T2  33.69 
 
 		 220 aa  96.3  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1732  putative ribonuclease T2 family protein  31.72 
 
 		 233 aa  95.5  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.370011 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2583  ribonuclease T2  29.35 
 
 		 225 aa  94.7  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1400  ribonuclease T2  31.91 
 
 		 232 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.338332  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3150  ribonuclease T2  30.65 
 
 		 230 aa  87  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1593  ribonuclease T2  33.16 
 
 		 301 aa  86.3  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2529  ribonuclease T2  32.62 
 
 		 229 aa  86.3  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1499  ribonuclease T2  32.63 
 
 		 216 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0146445  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2192  ribonuclease T2  30.56 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.381743  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0703  ribonuclease T2 family protein  26.88 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0694  ribonuclease T2 family protein  26.88 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0786  ribonuclease T2  30.09 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123523  normal  0.0777088 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1972  ribonuclease T2  30.48 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.715312  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0660  ribonuclease T2  30.77 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.315761 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0855  ribonuclease T2  29.79 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0254  ribonuclease T2  29.57 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0880  ribonuclease T2  29.26 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.558243  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2631  ribonuclease T2  29.03 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3807  ribonuclease T2  29.7 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290686 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0680  ribonuclease T2  32.47 
 
 		 200 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.767299  normal  0.958161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0919  ribonuclease T2  29.26 
 
 		 224 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.46623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3879  ribonuclease T2  30.05 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111737 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2292  ribonuclease T2  29.03 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.62004  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2259  ribonuclease T2  29.02 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.291915  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2370  ribonuclease T2  29.95 
 
 		 206 aa  62  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0715  ribonuclease T2  28.71 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2266  ribonuclease T2  29.26 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  0.473207 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0516  ribonuclease T2  27.62 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.13199  normal  0.104349 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2911  ribonuclease T2  31.75 
 
 		 252 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0103832  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2881  ribonuclease T2  33.33 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00579  ribonuclease I  24.18 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0699  ribonuclease I  24.18 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0525  ribonuclease I  24.18 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3033  ribonuclease I  24.18 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3014  Enterobacter ribonuclease  24.18 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00399142  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0633  ribonuclease I  24.18 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.988067  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0662  ribonuclease I  24.18 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00568  hypothetical protein  24.18 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0630  ribonuclease I  24.18 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1293  ribonuclease T2 family protein  34.38 
 
 		 315 aa  45.8  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2930  Ribonuclease protein  33.62 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3279  ribonuclease T2  28.1 
 
 		 350 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.127933 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2621  ribonuclease T2  32.8 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.415394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1151  ribonuclease I  26.04 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.299247 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3450  ribonuclease T2  30.08 
 
 		 356 aa  43.5  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.854152  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2118  putative ribonuclease protein  27.59 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.336205 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2188  ribonuclease T2 family protein  24.12 
 
 		 240 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0841  ribonuclease T2 family protein  24.12 
 
 		 240 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.259651  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2760  hypothetical protein  25.18 
 
 		 326 aa  42.7  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3777  ribonuclease T2  27.66 
 
 		 388 aa  42.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>