91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5649 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5649  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  100 
 
 
311 aa  601  1.0000000000000001e-171  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  36.03 
 
 
336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2873  hypothetical protein  29.75 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4342  folate-binding protein YgfZ  32.49 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.964763  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2848  LigA  31.1 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2127  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.14 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0727  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  22.81 
 
 
354 aa  64.7  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639994  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2938  folate-binding protein YgfZ  30.95 
 
 
304 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.428228  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2098  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase)  26.98 
 
 
354 aa  62.8  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.438328  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  28.97 
 
 
316 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.3 
 
 
369 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1904  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.91 
 
 
334 aa  61.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.195861  normal  0.523701 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1862  hypothetical protein  29.74 
 
 
323 aa  60.1  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.171418 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3032  folate-binding protein YgfZ  30.16 
 
 
304 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156046  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2860  folate-binding protein YgfZ  27.91 
 
 
308 aa  60.1  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1256  folate-binding protein YgfZ  29.03 
 
 
293 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1003  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.71 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1464  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.57 
 
 
354 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.24907  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.7 
 
 
369 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.3 
 
 
360 aa  56.2  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1463  GcvT-like aminomethyltransferase  30.83 
 
 
313 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0953124  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1391  folate-binding protein YgfZ  24.23 
 
 
321 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25690  folate-binding protein YgfZ  29.68 
 
 
369 aa  54.7  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1112  folate-binding protein YgfZ  24.23 
 
 
321 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4228  hypothetical protein  27.24 
 
 
315 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  26.92 
 
 
342 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2474  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  21.86 
 
 
347 aa  53.9  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1715  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30 
 
 
311 aa  53.5  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.2209 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1989  folate-binding protein YgfZ  30 
 
 
311 aa  53.5  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3414  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.69 
 
 
304 aa  53.5  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215504  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.43 
 
 
327 aa  52.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5037  folate-binding protein YgfZ  29.25 
 
 
369 aa  52.8  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2253  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.56 
 
 
317 aa  52.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1063  hypothetical protein  26.81 
 
 
313 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6150  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.84 
 
 
409 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.52 
 
 
324 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2547  folate-binding protein YgfZ  23.13 
 
 
325 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1100  folate-binding protein YgfZ  26.12 
 
 
279 aa  50.8  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.49 
 
 
352 aa  50.8  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2704  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.97 
 
 
293 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689598  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4019  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.77 
 
 
293 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1165  folate-binding protein YgfZ  26.71 
 
 
284 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.818193  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1468  folate-binding protein YgfZ  22.15 
 
 
346 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606747  normal  0.0230828 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1881  folate-binding protein YgfZ  24.34 
 
 
348 aa  50.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428189  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4331  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.86 
 
 
293 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6184  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.75 
 
 
344 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1427  folate-binding protein YgfZ  22.39 
 
 
346 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345601  normal  0.255059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4388  folate-binding protein YgfZ  26.39 
 
 
313 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.410002  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8240  folate-binding protein YgfZ  27.78 
 
 
335 aa  49.3  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496327  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0655  folate-binding protein YgfZ  25.85 
 
 
328 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1895  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.75 
 
 
344 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6837  folate-binding protein YgfZ  28.99 
 
 
364 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  20.55 
 
 
356 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1330  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.91 
 
 
328 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  26.37 
 
 
339 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  20.55 
 
 
356 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1782  hypothetical protein  21.64 
 
 
346 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000345252  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1379  folate-binding protein YgfZ  28.63 
 
 
345 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.97 
 
 
430 aa  47.4  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13620  ygfZ-like protein  27.34 
 
 
315 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3450  glycine cleavage T-protein barrel  26.59 
 
 
327 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1946  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.32 
 
 
317 aa  46.6  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1013  folate-binding protein YgfZ  25.98 
 
 
284 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1357  glycine cleavage T protein  26.91 
 
 
313 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.99203  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1117  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.06 
 
 
293 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  20.13 
 
 
349 aa  46.2  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3386  folate-binding protein YgfZ  26.92 
 
 
315 aa  46.2  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00306542  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1804  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.69 
 
 
344 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173465  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1238  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.67 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  30.13 
 
 
396 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4821  folate-binding protein YgfZ  28.04 
 
 
285 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.28 
 
 
325 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4298  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.36 
 
 
313 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1423  hypothetical protein  25 
 
 
313 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5195  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.42 
 
 
344 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1462  glycine cleavage system T protein aminomethyltransferase  29.14 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1737  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.8 
 
 
348 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00179211  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2152  glycine cleavage T-protein superfamily protein  28.74 
 
 
348 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101306  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0480  folate-binding protein YgfZ  25.21 
 
 
352 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1832  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.69 
 
 
344 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.45 
 
 
337 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0812  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.33 
 
 
273 aa  44.3  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000519539 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 
799 aa  44.3  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17390  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  27.59 
 
 
398 aa  43.9  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  35.96 
 
 
309 aa  43.9  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4673  folate-binding protein YgfZ  27.99 
 
 
284 aa  43.5  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363501  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.26 
 
 
366 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4304  folate-binding protein YgfZ  28.67 
 
 
284 aa  43.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  23.4 
 
 
326 aa  43.5  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  27.92 
 
 
375 aa  42.7  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0959  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.18 
 
 
288 aa  42.7  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>