More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1523 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1523  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
626 aa  1291    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0858  glycosyltransferase  39.9 
 
 
386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.358522  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 
392 aa  103  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  22.42 
 
 
399 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  23.9 
 
 
392 aa  97.1  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.75 
 
 
385 aa  96.3  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  26.28 
 
 
406 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 
441 aa  92.8  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  26.02 
 
 
406 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
404 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
416 aa  91.3  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  25.3 
 
 
396 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 
399 aa  91.3  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0220  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 
373 aa  90.9  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  24.62 
 
 
403 aa  90.5  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.25 
 
 
396 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 
381 aa  89.7  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  22.31 
 
 
406 aa  89  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  22.31 
 
 
406 aa  89  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  26.37 
 
 
393 aa  87.8  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  23.37 
 
 
402 aa  87.8  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
396 aa  87.8  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  22.98 
 
 
426 aa  87.4  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
405 aa  87  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  23.8 
 
 
406 aa  87  9e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.81 
 
 
403 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1996  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
367 aa  85.9  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0691436 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.27 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  22.95 
 
 
398 aa  85.5  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 
400 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  25 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  23.54 
 
 
380 aa  84  0.000000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0559  glycosyl transferase, group 1  25.3 
 
 
411 aa  84  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0387  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  27.95 
 
 
408 aa  84  0.000000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.270074  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5198  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 
426 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.603506  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  24.42 
 
 
406 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  21.87 
 
 
387 aa  82.8  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1801  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 
408 aa  82.4  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 
377 aa  82.4  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3011  putative glycosyltransferase  26.14 
 
 
380 aa  82.8  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
819 aa  82  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  23.73 
 
 
820 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2241  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  22.76 
 
 
769 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  23.37 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0701  glycosyl transferase group 1  21.97 
 
 
371 aa  79.7  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0710  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.31 
 
 
444 aa  79  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  26.24 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2540  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
398 aa  79  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0159  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0584  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
427 aa  78.2  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  21.84 
 
 
655 aa  78.2  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0959  glycosyl transferase group 1  23.13 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  23.43 
 
 
430 aa  77.8  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5260  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 
420 aa  77  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.68 
 
 
380 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5598  glycosyl transferase, group 1  24.35 
 
 
344 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 
387 aa  76.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0993  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 
382 aa  77  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0978  glycosyl transferase, group 1  25.39 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2187  glycosyl transferase group 1  24.08 
 
 
344 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0604226  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  23.36 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  28.48 
 
 
381 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2309  glycosyl transferase, group 1  24.08 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.05 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  25.85 
 
 
385 aa  74.7  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0825  glycosyl transferase group 1  22.31 
 
 
434 aa  74.7  0.000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04450  glycosyltransferase  23.53 
 
 
405 aa  74.7  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  22.96 
 
 
397 aa  74.3  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  22.78 
 
 
461 aa  74.3  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 
385 aa  74.3  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3634  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
417 aa  73.9  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07870  glycosyltransferase  24.11 
 
 
391 aa  74.3  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0755  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 
375 aa  73.9  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 
403 aa  73.6  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  24.45 
 
 
383 aa  73.9  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 
380 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  26.73 
 
 
393 aa  73.6  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
416 aa  73.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  21.57 
 
 
435 aa  73.2  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.555992 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3802  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 
394 aa  73.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.769025  normal  0.0224743 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  25 
 
 
380 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  22.05 
 
 
390 aa  73.2  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2441  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  23.81 
 
 
446 aa  73.6  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.662083  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1589  glycosyltransferase  25.12 
 
 
393 aa  73.2  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.679679 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  25.44 
 
 
373 aa  72.4  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0761  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 
376 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  23.57 
 
 
394 aa  72.8  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1070  glycosyl transferase, group 1  26.51 
 
 
434 aa  72.8  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 
800 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.37 
 
 
380 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0775  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 
376 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193821  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.05 
 
 
380 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0402  glycosyltransferase, group 1 family protein  22.94 
 
 
443 aa  72  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
413 aa  72  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2485  glycosyl transferase group 1  24.06 
 
 
387 aa  72  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  23.37 
 
 
812 aa  72  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>