More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0966 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0966  ABC transporter related  100 
 
 
310 aa  617  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2003  ABC transporter related  39.41 
 
 
321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.703276  normal  0.434754 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  33.76 
 
 
312 aa  168  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  33.02 
 
 
320 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  33.44 
 
 
312 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  33.33 
 
 
312 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  32.58 
 
 
312 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  32.8 
 
 
312 aa  166  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  32.8 
 
 
312 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  32.8 
 
 
312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  32.8 
 
 
312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  32.8 
 
 
312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3246  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.06 
 
 
321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  28.89 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.73 
 
 
328 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.41 
 
 
324 aa  162  9e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.84 
 
 
308 aa  160  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.25 
 
 
308 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  32.42 
 
 
330 aa  159  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.87 
 
 
324 aa  159  4e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  37.32 
 
 
308 aa  159  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.25 
 
 
308 aa  159  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  36.89 
 
 
304 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1225  ABC transporter related  36.73 
 
 
310 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.9 
 
 
337 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.35 
 
 
323 aa  156  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54604  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  28.66 
 
 
325 aa  156  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.35 
 
 
323 aa  156  3e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  29.45 
 
 
328 aa  156  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  28.12 
 
 
314 aa  155  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.39 
 
 
279 aa  155  8e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0785  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.1 
 
 
324 aa  155  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.04 
 
 
316 aa  154  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2020  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  29.81 
 
 
359 aa  154  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197661  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2831  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  31.11 
 
 
366 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116733  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2875  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.11 
 
 
366 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.77 
 
 
323 aa  154  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2860  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.11 
 
 
366 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162842  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_461  ABC-type transport system, ATPase component  31.39 
 
 
316 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00512826  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.74 
 
 
326 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0553  ABC transporter related  34.68 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.07 
 
 
339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.72 
 
 
308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.15 
 
 
324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  28.66 
 
 
315 aa  153  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  33.7 
 
 
297 aa  152  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4189  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  28.8 
 
 
307 aa  153  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  27.83 
 
 
345 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  27.63 
 
 
320 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  28.34 
 
 
309 aa  151  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 
294 aa  151  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  30.32 
 
 
327 aa  151  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1123  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.62 
 
 
331 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4184  daunorubicin resistance ABC transporter ATP- binding subunit  35.16 
 
 
328 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00696491  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  35.24 
 
 
266 aa  150  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  29.39 
 
 
311 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0568  ABC transporter related  36.73 
 
 
241 aa  150  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1036  ABC transporter related protein  37.04 
 
 
246 aa  150  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1683  ABC transporter related  38.01 
 
 
253 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  34.98 
 
 
337 aa  150  3e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1778  ABC transporter related protein  27.3 
 
 
317 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0112874  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6251  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.93 
 
 
353 aa  149  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382006  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0392  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.55 
 
 
347 aa  149  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  26.71 
 
 
315 aa  149  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  34.1 
 
 
354 aa  149  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4655  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.23 
 
 
449 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3439  ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 
253 aa  149  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4384  ABC transporter related  32.58 
 
 
280 aa  149  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.548465 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2896  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  28.21 
 
 
339 aa  149  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595289  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.74 
 
 
328 aa  149  8e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0286  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.23 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3148  ABC transporter related  35.29 
 
 
253 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0680393  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3717  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32 
 
 
380 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0867076  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  31.34 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  29.08 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1127  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.91 
 
 
334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0903207  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  30.15 
 
 
328 aa  147  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8872  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.39 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  28.52 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  28.9 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  36.94 
 
 
338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.63 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  36.71 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0496  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.77 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.516721  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7216  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.51 
 
 
316 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927821  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.02 
 
 
329 aa  147  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  30.37 
 
 
309 aa  147  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  30.37 
 
 
309 aa  147  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0243  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.03 
 
 
316 aa  147  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0708774  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  36.49 
 
 
338 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.65 
 
 
317 aa  147  3e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  29.79 
 
 
303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  35.32 
 
 
316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  28.16 
 
 
338 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1807  ABC transporter, ATP-binding protein  34.84 
 
 
253 aa  146  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3468  ABC transporter, ATP-binding protein  34.39 
 
 
253 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000910882  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.03 
 
 
323 aa  146  5e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5589  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.68 
 
 
327 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.27 
 
 
319 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>