95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_R0030 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_R0030  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0013  tRNA-Val  96.36 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.736454 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0864  hypothetical protein  94.64 
 
 		 276 bp  87.7  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0014  tRNA-Val  94.64 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Val-3  tRNA-Val  93.22 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0074  tRNA-Val  92.86 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0744587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0013  tRNA-Val  92.86 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0013  tRNA-Val  92.86 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688167  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0059  tRNA-Val  92.86 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.40098  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0026  tRNA-Val  91.07 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0031  tRNA-Val  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0047  tRNA-Val  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.561657  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0053  tRNA-Val  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.694322  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0047  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0052  tRNA-Val  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0063  tRNA-Val  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00355332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0027  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.480715 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0032  tRNA-Val  88.46 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002348 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0043  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0061  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.272807 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0045  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.374674 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0050  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0041  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0044  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.306747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0065  tRNA-Val  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0059636  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0953  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0073  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0039  tRNA-Val  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.910644  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4574  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0200099  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0058  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0048  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0187429  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt01  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t15  tRNA-Val  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0026  tRNA-Val  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0408746  normal  0.0924489 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0029  tRNA-Val  87.27 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.742373  hitchhiker  0.00208243 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0020  tRNA-Val  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0496105  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0024  tRNA-Val  86.44 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.508678  normal  0.235406 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1555  tRNA-Val  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0024  tRNA-Val  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.198375  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0043  tRNA-Val  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0172535  normal  0.864924 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14900  tRNA-Val  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0042  tRNA-Val  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153066  hitchhiker  0.00834851 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0030  tRNA-Val  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0105  tRNA-Val  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0037  tRNA-Val  87.27 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.960362  normal  0.0810888 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0058  tRNA-Val  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000337816  normal  0.447594 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0032  tRNA-Val  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0033  tRNA-Val  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03462  tRNA-Val  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000504437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0035  tRNA-Val  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.81932  normal  0.306729 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0022  tRNA-Val  86.79 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0121384  normal  0.0431401 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0028  tRNA-Val  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118191  normal  0.542965 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0035  tRNA-Val  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000268717  normal  0.222107 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0064  tRNA-Val  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.192566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0029  tRNA-Val  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198673  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Val-2  tRNA-Val  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.516841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0001  tRNA-Val  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000207511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0014  tRNA-Val  96.55 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0064  tRNA-Val  96.55 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.614158  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0065  tRNA-Val  96.55 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0028  tRNA-Val  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.163089  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0053  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000250607  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0046  tRNA-Val  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.052544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0019  tRNA-Val  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0007  tRNA-Val  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0174963 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0045  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0020  tRNA-Val  85.71 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0073  tRNA-Val  86.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.222054  normal  0.378802 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0002  tRNA-Val  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.884588  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0045  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0012  tRNA-Val  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.207104  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0043  tRNA-Val  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.125725  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0611  tRNA-Val  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0857734  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0045  tRNA-Val  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0049  tRNA-Val  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0055  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.105758  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0054  tRNA-Val  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.452754 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0024  tRNA-Val  84.13 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0047  tRNA-Val  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2843  hypothetical protein  85.45 
 
 		 399 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0331098  normal  0.0204354 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0052  tRNA-Val  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0054  tRNA-Val  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.041835  normal  0.0189876 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0018  tRNA-Val  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0026  tRNA-Val  84.13 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.289153  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0024  tRNA-Val  84.13 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0059  tRNA-Val  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412801  normal  0.045511 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0017  tRNA-Val  86.27 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.598097  normal  0.464383 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6005  tRNA-Val  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.859444 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0031  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0051  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000163002  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0001  tRNA-Val  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.709613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0069  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0044  tRNA-Val  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00403684  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0040  tRNA-Val  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0031  tRNA-Val  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0117254 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>