250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2456 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2456  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 
159 aa  303  9.000000000000001e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2166  F0F1 ATP synthase subunit B  98.7 
 
 
154 aa  290  5e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  28.21 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  31.76 
 
 
175 aa  77.4  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  32.05 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  33.11 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  30.46 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  29.33 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  29.45 
 
 
176 aa  73.9  0.0000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  26.92 
 
 
173 aa  73.9  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  26.92 
 
 
173 aa  73.9  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  30.87 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  25.81 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  30.38 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  25.81 
 
 
162 aa  72  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  32.05 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  32.05 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  32.69 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  30.63 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  32.05 
 
 
168 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3740  ATP synthase F0, B subunit  30.28 
 
 
194 aa  70.9  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  32.05 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  32.05 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  32.05 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  33.99 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  32.9 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  32.05 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  32.05 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  32.05 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  26.35 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  33.99 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  28.75 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  30.6 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0199  ATP synthase F0, B subunit  29.41 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  29.68 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  29.86 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  29.3 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  29.05 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  27.56 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  30.07 
 
 
181 aa  67.8  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  32.68 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  27.56 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  32.26 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  32.26 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  30.07 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  31.37 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  29.14 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  27.7 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  29.05 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  28.19 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  29.8 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  31.82 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  27.15 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  31.61 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  31.82 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  29.05 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  29.41 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  31.29 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  31.03 
 
 
181 aa  64.3  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  31.61 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  23.13 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  31.62 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  29.41 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  29.41 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1242  F0F1 ATP synthase subunit B  28.36 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  29.41 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  27.21 
 
 
175 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  30.19 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  27.52 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  26.32 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  26 
 
 
199 aa  62  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4134  F0F1 ATP synthase subunit B  30.07 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000412529  hitchhiker  0.00502547 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  27.15 
 
 
203 aa  61.2  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl111  ATP synthase subunit B  25.97 
 
 
177 aa  61.2  0.000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  27.89 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3929  F0F1 ATP synthase subunit B  30.07 
 
 
156 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00620185 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4021  F0F1 ATP synthase subunit B  30.07 
 
 
156 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165729  normal  0.907421 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3879  ATP synthase F0, B subunit  29.61 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000993244  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  25.68 
 
 
152 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  25.32 
 
 
164 aa  60.5  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  27.39 
 
 
156 aa  60.5  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2748  F0F1 ATP synthase subunit B  29.14 
 
 
156 aa  60.5  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000265032  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0268  ATP synthase F0, B subunit  27.21 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  24.68 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  25.17 
 
 
157 aa  58.9  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  26.17 
 
 
175 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2674  ATP synthase F0, B subunit  28.66 
 
 
302 aa  58.9  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.544708  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  25.66 
 
 
164 aa  58.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 
174 aa  57.8  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  29.8 
 
 
156 aa  57.8  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  30.52 
 
 
156 aa  57.4  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  25.66 
 
 
195 aa  57  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 
175 aa  57.4  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03620  F0F1 ATP synthase subunit B  27.33 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00121932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  27.33 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  27.33 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4104  F0F1 ATP synthase subunit B  27.33 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000546623  normal  0.0856146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  30.71 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5172  F0F1 ATP synthase subunit B  27.33 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000636069  hitchhiker  0.00809624 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4252  F0F1 ATP synthase subunit B  27.33 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>