More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1498 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1498  formyl transferase domain-containing protein  100 
 
 		 239 aa  487  1e-137  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.555027  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1312  conserved hypothetical protein, formyltransferase domain protein  56.88 
 
 		 238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353772  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1325  formyl transferase domain-containing protein  81.62 
 
 		 136 aa  223  2e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2599  formyl transferase domain protein  36.59 
 
 		 242 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0517  formyltransferase, putative  28.92 
 
 		 259 aa  86.7  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0521  putative formyltransferase  28.92 
 
 		 259 aa  86.3  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3943  formyl transferase domain protein  29.68 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0655698 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2402  amino acid adenylation  29.61 
 
 		 1519 aa  75.1  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02540  methionyl-tRNA formyltransferase  29.81 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0264406  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2131  hypothetical protein  30.27 
 
 		 1439 aa  72.4  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0615  formyl transferase domain protein  27.27 
 
 		 331 aa  72.4  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.66152  normal  0.206084 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  28.85 
 
 		 8915 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1236  formyltransferase, putative  29.89 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000369668  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1233  conserved hypothetical protein, putative formyltransferase  31.13 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000667548  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3464  fused UDP-L-Ara4N formyltransferase ; UDP-GlcA C- 4'-decarboxylase  27.21 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65465  hitchhiker  0.00203442 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0633  formyl transferase domain protein  27.53 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.353643  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5938  formyl transferase domain-containing protein  25.15 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.723726  normal  0.313498 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1161  formyl transferase domain protein  25.9 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0838  amino acid adenylation domain-containing protein  27.44 
 
 		 1541 aa  63.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9641  peptide synthetase  27.82 
 
 		 3761 aa  63.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2025  Formyl transferase-like  31.25 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.45542 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  28.65 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18350  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  30.89 
 
 		 662 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1095  formyl transferase domain protein  26.72 
 
 		 316 aa  62  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3012  formyl transferase domain-containing protein  29.37 
 
 		 206 aa  62  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  30.17 
 
 		 311 aa  62  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0383  methionyl-tRNA formyltransferase  27.06 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  29.49 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  32.17 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  32.5 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2244  formyl transferase domain protein  27.36 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634328 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0040  methionyl-tRNA formyltransferase  32.06 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1515  formyltransferase, putative  34 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.138286  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2573  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.37 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0449  methionyl-tRNA formyltransferase  27.27 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353128  normal  0.364478 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  32.95 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159164  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1591  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  37.97 
 
 		 662 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  30.83 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3523  methionyl-tRNA formyltransferase  26.19 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1412  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5268  methionyl-tRNA formyltransferase  26.71 
 
 		 313 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3690  formyl transferase domain protein  27.21 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  33.57 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3697  putative formyltransferase  25.41 
 
 		 308 aa  58.5  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0663  methionyl-tRNA formyltransferase  30 
 
 		 312 aa  58.5  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  25.66 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0959  methionyl-tRNA formyltransferase  30.71 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.500083  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0691  formyl transferase domain-containing protein  30.61 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4080  methionyl-tRNA formyltransferase  30.68 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67477  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  24.61 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2588  formyl transferase domain protein  32.46 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.633382 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1572  methionyl-tRNA formyltransferase  36.25 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4113  methionyl-tRNA formyltransferase  28.26 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195925  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0972  methionyl-tRNA formyltransferase  28.57 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.319816  normal  0.276171 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  30.6 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1799  putative formyltransferase  26.4 
 
 		 311 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092642 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  22.32 
 
 		 313 aa  57  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1548  methionyl-tRNA formyltransferase  36.25 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0945  formyl transferase domain-containing protein  32.29 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777167  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1114  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.95 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.660024 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  37.36 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  31.67 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  34.26 
 
 		 315 aa  55.5  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2468  formyl transferase domain protein  27.12 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0908762 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  30.68 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1860  methionyl-tRNA formyltransferase  24.24 
 
 		 315 aa  55.5  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.346485  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1644  methionyl-tRNA formyltransferase  32.52 
 
 		 322 aa  55.1  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2246  methionyl-tRNA formyltransferase  28.91 
 
 		 277 aa  55.1  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.155767  hitchhiker  0.00775212 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0883  methionyl-tRNA formyltransferase  29.66 
 
 		 334 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4226  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  26.76 
 
 		 663 aa  54.7  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2843  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  31.03 
 
 		 668 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2156  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  36.14 
 
 		 660 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1844  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  27.34 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000807934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2926  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  25.81 
 
 		 672 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  32.31 
 
 		 307 aa  54.7  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2388  putative formyltransferase  28.09 
 
 		 311 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.482791  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3920  methionyl-tRNA formyltransferase  23.23 
 
 		 325 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  34.75 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  26.17 
 
 		 311 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  27.38 
 
 		 330 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  31.93 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  31.67 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  31.67 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  31.67 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  31.93 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1778  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.8 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  31.67 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  30.08 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  31.67 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  31.67 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4344  putative methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.291345 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4017  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  32.91 
 
 		 660 aa  54.3  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.296213  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  36.26 
 
 		 309 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0965  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  26.42 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156307 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1787  methionyl-tRNA formyltransferase  27.62 
 
 		 319 aa  53.9  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  31.93 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  30.08 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0641  methionyl-tRNA formyltransferase  38.1 
 
 		 310 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  32.17 
 
 		 318 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2763  formyl transferase domain protein  37.93 
 
 		 285 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal  0.333603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>