More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1114 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1114  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
191 aa  384  1e-106  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.660024 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1845  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.79 
 
 
206 aa  202  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0151726  normal  0.945395 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.12 
 
 
218 aa  198  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000519718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1759  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
206 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.192447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2363  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.47 
 
 
203 aa  195  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1773  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.74 
 
 
206 aa  191  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000352591  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1816  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.46 
 
 
204 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0209797 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0733  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.32 
 
 
211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.54904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2403  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.92 
 
 
204 aa  188  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2609  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.44 
 
 
225 aa  188  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.698342  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.44 
 
 
225 aa  187  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2703  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.94 
 
 
225 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00267955  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.17 
 
 
206 aa  186  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000463189  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.12 
 
 
205 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.59 
 
 
205 aa  185  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.400719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.28 
 
 
227 aa  184  9e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877023 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.98 
 
 
215 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.26 
 
 
202 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.79 
 
 
220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1812  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.26 
 
 
202 aa  181  6e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2618  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.44 
 
 
212 aa  180  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2107  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.88 
 
 
206 aa  177  8e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000116567  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1630  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.68 
 
 
214 aa  177  9e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3853  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.81 
 
 
220 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.36 
 
 
216 aa  175  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.38967  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0532  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.21 
 
 
202 aa  174  6e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00415647  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2666  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.02 
 
 
213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2513  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.57 
 
 
230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2722  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.98 
 
 
216 aa  171  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.826865  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.51 
 
 
220 aa  171  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2324  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.31 
 
 
222 aa  171  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2454  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.41 
 
 
216 aa  170  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.78 
 
 
211 aa  169  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.226239  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1657  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.85 
 
 
221 aa  169  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2333  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.41 
 
 
216 aa  168  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213803  normal  0.274367 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0482  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.88 
 
 
313 aa  168  5e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1407  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.83 
 
 
202 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1776  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.31 
 
 
213 aa  166  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000344484  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0236  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.04 
 
 
212 aa  164  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.822796 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0643  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.09 
 
 
217 aa  164  5.9999999999999996e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104742  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3462  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.61 
 
 
217 aa  164  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19888  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1531  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.29 
 
 
197 aa  164  8e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.468098  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1181  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.53 
 
 
210 aa  164  9e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328833  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1976  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.31 
 
 
208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2741  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.24 
 
 
221 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280146  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2168  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.11 
 
 
224 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1738  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.58 
 
 
209 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0809  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.74 
 
 
203 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1246  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.95 
 
 
216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992946 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.58 
 
 
205 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0253  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.53 
 
 
229 aa  161  6e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1890  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.49 
 
 
213 aa  161  6e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.505321 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2535  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.74 
 
 
220 aa  161  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0808214 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0785  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.22 
 
 
220 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160821 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1899  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.74 
 
 
220 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4565  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.17 
 
 
222 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2510  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.74 
 
 
220 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2208  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.53 
 
 
224 aa  159  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.128407  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2428  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.7 
 
 
220 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  hitchhiker  0.000000443644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2557  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.7 
 
 
220 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0515  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.05 
 
 
226 aa  159  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.549179 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2997  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.89 
 
 
214 aa  158  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.386914  hitchhiker  0.000268593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1632  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.71 
 
 
216 aa  158  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0554809 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5842  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.7 
 
 
220 aa  158  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0964  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.97 
 
 
218 aa  158  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597426 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2448  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.13 
 
 
222 aa  157  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.325008  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1967  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.02 
 
 
236 aa  158  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2488  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.41 
 
 
218 aa  157  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.062829  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1598  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.89 
 
 
217 aa  156  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.718303  normal  0.398382 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1837  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.95 
 
 
197 aa  156  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.117962 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0126  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.66 
 
 
198 aa  155  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3332  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.1 
 
 
214 aa  155  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131556 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52050  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.63 
 
 
222 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472013 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3157  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.7 
 
 
217 aa  155  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409852  normal  0.0214096 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0576  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.27 
 
 
221 aa  154  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.116598 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.92 
 
 
222 aa  154  6e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1574  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.08 
 
 
229 aa  154  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1824  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.31 
 
 
218 aa  153  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00661254  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2638  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.25 
 
 
209 aa  153  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0230258  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1456  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40 
 
 
209 aa  153  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.551821 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5548  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.57 
 
 
220 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3690  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.71 
 
 
216 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.864702  decreased coverage  0.000250374 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1477  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.55 
 
 
200 aa  152  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0913  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.86 
 
 
210 aa  152  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3222  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.25 
 
 
198 aa  152  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4054  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.71 
 
 
217 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1281  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.51 
 
 
195 aa  152  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2538  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.54 
 
 
206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0740  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.36 
 
 
209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3391  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.68 
 
 
194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2956  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.41 
 
 
215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.502503  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0709  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.68 
 
 
205 aa  152  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1572  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.42 
 
 
219 aa  152  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481989 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.68 
 
 
205 aa  152  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1649  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.37 
 
 
197 aa  151  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.318783  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1570  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.42 
 
 
219 aa  152  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000536598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1896  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.42 
 
 
219 aa  152  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1664  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.71 
 
 
217 aa  151  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278539  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.17 
 
 
217 aa  151  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0400953 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2729  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.68 
 
 
194 aa  151  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>