39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1262 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1262  general glycosylation pathway protein  100 
 
 
297 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0602  general glycosylation pathway protein  99.66 
 
 
297 aa  600  1e-170  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1137  general glycosylation pathway protein  98.65 
 
 
297 aa  594  1e-169  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1201  general glycosylation pathway protein  58.36 
 
 
297 aa  343  2e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0446  hypothetical protein  57.58 
 
 
298 aa  343  2.9999999999999997e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1353  general glycosylation pathway protein  55.29 
 
 
301 aa  332  4e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1766  general glycosylation pathway protein  53 
 
 
301 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0948  general glycosylation pathway protein  51.02 
 
 
299 aa  275  6e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.269754  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1675  hypothetical protein  45.3 
 
 
301 aa  251  1e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.877209  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0057  general glycosylation pathway protein  35.27 
 
 
307 aa  146  5e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3950  hypothetical protein  29.9 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3768  hypothetical protein  29.9 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0500  hypothetical protein  29.9 
 
 
320 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3768  hypothetical protein  29.53 
 
 
315 aa  113  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3824  hypothetical protein  29.57 
 
 
320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0540  hypothetical protein  29 
 
 
320 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3489  hypothetical protein  29 
 
 
317 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0541  hypothetical protein  29 
 
 
320 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3535  hypothetical protein  32.52 
 
 
325 aa  105  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0651  hypothetical protein  31.17 
 
 
329 aa  97.4  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0771  hypothetical protein  28.4 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1457  hypothetical protein  33.33 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0365  accessory colonization factor AcfB  39.44 
 
 
626 aa  53.9  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.96 
 
 
451 aa  52.8  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3301  pyruvate carboxyltransferase  31.96 
 
 
609 aa  52.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.709105 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1936  hypothetical protein  31.58 
 
 
155 aa  48.1  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.191079  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33460  general glycosylation protein  30.86 
 
 
90 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0289  methyl-accepting chemotaxis protein  27.01 
 
 
665 aa  47.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1307  methyl-accepting chemotaxis protein  37.84 
 
 
596 aa  47.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917497  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0052  putative methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  27.27 
 
 
516 aa  47.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0520  HMGL-like domain-containing protein  28.57 
 
 
604 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.999411  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1549  pyruvate carboxyltransferase  29.17 
 
 
609 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2483  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.97 
 
 
464 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.132022 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06690  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.52 
 
 
534 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  33.33 
 
 
706 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0102  pyruvate carboxyltransferase  26.89 
 
 
611 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
1078 aa  43.1  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.08 
 
 
606 aa  42.7  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000541258  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0191  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.4 
 
 
498 aa  42.7  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.332508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>