38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1137 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1137  general glycosylation pathway protein  100 
 
 
297 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1262  general glycosylation pathway protein  98.65 
 
 
297 aa  594  1e-169  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0602  general glycosylation pathway protein  98.99 
 
 
297 aa  596  1e-169  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0446  hypothetical protein  56.9 
 
 
298 aa  337  9.999999999999999e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1201  general glycosylation pathway protein  57.34 
 
 
297 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1353  general glycosylation pathway protein  55.29 
 
 
301 aa  330  2e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1766  general glycosylation pathway protein  52.33 
 
 
301 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0948  general glycosylation pathway protein  50.68 
 
 
299 aa  272  4.0000000000000004e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.269754  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1675  hypothetical protein  44.63 
 
 
301 aa  246  3e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.877209  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0057  general glycosylation pathway protein  32.11 
 
 
307 aa  144  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3768  hypothetical protein  29.9 
 
 
320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3950  hypothetical protein  29.9 
 
 
320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0500  hypothetical protein  29.9 
 
 
320 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3768  hypothetical protein  29.53 
 
 
315 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3824  hypothetical protein  29.57 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0540  hypothetical protein  29 
 
 
320 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3489  hypothetical protein  29 
 
 
317 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0541  hypothetical protein  29 
 
 
320 aa  106  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3535  hypothetical protein  32.11 
 
 
325 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0651  hypothetical protein  30.36 
 
 
329 aa  91.3  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1457  hypothetical protein  33.33 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0771  hypothetical protein  27.57 
 
 
287 aa  68.9  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0365  accessory colonization factor AcfB  41.54 
 
 
626 aa  53.1  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3301  pyruvate carboxyltransferase  30.3 
 
 
609 aa  49.7  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.709105 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.25 
 
 
451 aa  49.7  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0052  putative methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  28.18 
 
 
516 aa  49.3  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33460  general glycosylation protein  32.1 
 
 
90 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1307  methyl-accepting chemotaxis protein  37.84 
 
 
596 aa  47.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917497  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1936  hypothetical protein  31.58 
 
 
155 aa  48.1  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.191079  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.43 
 
 
606 aa  45.8  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000541258  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0289  methyl-accepting chemotaxis protein  26.28 
 
 
665 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  40 
 
 
706 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06690  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.52 
 
 
534 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0520  HMGL-like domain-containing protein  28.57 
 
 
604 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.999411  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1549  pyruvate carboxyltransferase  28.12 
 
 
609 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2092  pyruvate carboxyltransferase  24.27 
 
 
620 aa  43.5  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.238477 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2483  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.85 
 
 
464 aa  42.7  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.132022 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1181  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28 
 
 
621 aa  42.7  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>