19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1936 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1936  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  305  1.0000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.191079  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2035  hypothetical protein  55.84 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.876573  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33460  general glycosylation protein  54.44 
 
 		 90 aa  103  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2759  hypothetical protein  34.72 
 
 		 155 aa  86.3  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.474468  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0057  general glycosylation pathway protein  32.45 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0651  hypothetical protein  36.17 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3535  hypothetical protein  32.69 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3768  hypothetical protein  35.48 
 
 		 315 aa  57.4  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3489  hypothetical protein  33.63 
 
 		 317 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3768  hypothetical protein  35.29 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3950  hypothetical protein  35.29 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0541  hypothetical protein  33.63 
 
 		 320 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3824  hypothetical protein  35.29 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0500  hypothetical protein  35.29 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0540  hypothetical protein  35.29 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2932  hypothetical protein  27.48 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000232307  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1675  hypothetical protein  24.32 
 
 		 301 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.877209  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1766  general glycosylation pathway protein  30.93 
 
 		 301 aa  44.3  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4230  hypothetical protein  26.71 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.081748  normal  0.422268 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>