48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0651 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0651  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  660    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3535  hypothetical protein  63.03 
 
 		 325 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0540  hypothetical protein  59.82 
 
 		 320 aa  368  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0541  hypothetical protein  59.88 
 
 		 320 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3824  hypothetical protein  59.27 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3489  hypothetical protein  59.82 
 
 		 317 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3950  hypothetical protein  59.27 
 
 		 320 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3768  hypothetical protein  59.27 
 
 		 320 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0500  hypothetical protein  58.97 
 
 		 320 aa  361  9e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3768  hypothetical protein  58.68 
 
 		 315 aa  352  4e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0057  general glycosylation pathway protein  36.12 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1201  general glycosylation pathway protein  34.26 
 
 		 297 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0446  hypothetical protein  32.27 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1353  general glycosylation pathway protein  29.3 
 
 		 301 aa  109  6e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0948  general glycosylation pathway protein  30.98 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.269754  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1766  general glycosylation pathway protein  29.8 
 
 		 301 aa  87  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1262  general glycosylation pathway protein  30.57 
 
 		 297 aa  86.7  5e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0602  general glycosylation pathway protein  30.13 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1675  hypothetical protein  28.93 
 
 		 301 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.877209  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1137  general glycosylation pathway protein  29.69 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1457  hypothetical protein  30.38 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1936  hypothetical protein  36.17 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.191079  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33460  general glycosylation protein  35.56 
 
 		 90 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0419  CBS domain containing protein  39.74 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.092236  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2759  hypothetical protein  32.99 
 
 		 155 aa  54.3  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.474468  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2585  diguanylate phosphodiesterase  30.1 
 
 		 424 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0503461  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.11 
 
 		 451 aa  50.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0771  hypothetical protein  28.98 
 
 		 287 aa  50.4  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2455  diguanylate phosphodiesterase  30.1 
 
 		 424 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000463502 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1033  diguanylate phosphodiesterase  30.68 
 
 		 413 aa  49.3  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2537  diguanylate phosphodiesterase  29.13 
 
 		 424 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119746  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1925  diguanylate phosphodiesterase  29.13 
 
 		 424 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544322  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2561  diguanylate phosphodiesterase  29.13 
 
 		 424 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0195477 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3188  diguanylate phosphodiesterase  30.43 
 
 		 436 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.117578 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0758  diguanylate phosphodiesterase  29.13 
 
 		 424 aa  46.6  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121187  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5868  diguanylate phosphodiesterase  28.57 
 
 		 424 aa  46.2  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0145256  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6290  diguanylate phosphodiesterase  33.7 
 
 		 428 aa  46.2  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2483  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.26 
 
 		 464 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.132022 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0546  diguanylate phosphodiesterase  30.43 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49841  normal  0.628054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3301  pyruvate carboxyltransferase  27.27 
 
 		 609 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.709105 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0778  diguanylate phosphodiesterase  29.35 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.263766  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1176  diguanylate phosphodiesterase  36 
 
 		 411 aa  43.5  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0074  hypothetical protein  35.35 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.157936  normal  0.959579 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2960  diguanylate phosphodiesterase  32.61 
 
 		 428 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.735556  normal  0.776936 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2938  diguanylate phosphodiesterase  32.61 
 
 		 428 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2324  diguanylate phosphodiesterase  32.61 
 
 		 428 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00890506  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2288  diguanylate phosphodiesterase  32.29 
 
 		 419 aa  43.1  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000327147  normal  0.604082 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0751  EAL domain-containing protein  28.16 
 
 		 424 aa  42.7  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>