36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1353 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1353  general glycosylation pathway protein  100 
 
 		 301 aa  607  9.999999999999999e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0446  hypothetical protein  65.88 
 
 		 298 aa  404  1.0000000000000001e-112  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1201  general glycosylation pathway protein  64.19 
 
 		 297 aa  397  1e-109  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0948  general glycosylation pathway protein  65.65 
 
 		 299 aa  380  1e-104  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.269754  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1766  general glycosylation pathway protein  57.24 
 
 		 301 aa  352  4e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0602  general glycosylation pathway protein  55.68 
 
 		 297 aa  311  6.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1262  general glycosylation pathway protein  55.31 
 
 		 297 aa  309  5e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1137  general glycosylation pathway protein  55.31 
 
 		 297 aa  306  2.0000000000000002e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1675  hypothetical protein  48.31 
 
 		 301 aa  281  1e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.877209  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0057  general glycosylation pathway protein  39.68 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0651  hypothetical protein  29.3 
 
 		 329 aa  109  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3824  hypothetical protein  27.84 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0540  hypothetical protein  27.74 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3950  hypothetical protein  27.84 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3768  hypothetical protein  27.84 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3489  hypothetical protein  27.84 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0500  hypothetical protein  27.84 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0541  hypothetical protein  27.84 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3535  hypothetical protein  29.96 
 
 		 325 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3768  hypothetical protein  29.13 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0771  hypothetical protein  32.38 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1457  hypothetical protein  28.32 
 
 		 292 aa  79  0.00000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2483  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.97 
 
 		 464 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.132022 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3301  pyruvate carboxyltransferase  25.77 
 
 		 609 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.709105 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0052  putative methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  25.96 
 
 		 516 aa  47.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0191  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 498 aa  47  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.332508  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1307  methyl-accepting chemotaxis protein  41.67 
 
 		 596 aa  46.2  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917497  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1549  pyruvate carboxyltransferase  29 
 
 		 609 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33460  general glycosylation protein  30.11 
 
 		 90 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.58 
 
 		 622 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.34 
 
 		 622 aa  43.1  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2662  EAL domain-containing protein  31.87 
 
 		 428 aa  42.7  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31527  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0419  CBS domain containing protein  32.56 
 
 		 420 aa  42.7  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.092236  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2759  hypothetical protein  26.47 
 
 		 155 aa  42.7  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.474468  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.17 
 
 		 690 aa  42.7  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0556  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.17 
 
 		 690 aa  42.7  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>