36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0948 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0948  general glycosylation pathway protein  100 
 
 
299 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.269754  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1353  general glycosylation pathway protein  65.65 
 
 
301 aa  403  1e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1201  general glycosylation pathway protein  58.05 
 
 
297 aa  352  4e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0446  hypothetical protein  58.5 
 
 
298 aa  350  1e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1766  general glycosylation pathway protein  53.18 
 
 
301 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0602  general glycosylation pathway protein  51.09 
 
 
297 aa  280  2e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1262  general glycosylation pathway protein  51.09 
 
 
297 aa  279  4e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1137  general glycosylation pathway protein  50.73 
 
 
297 aa  276  3e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1675  hypothetical protein  46.92 
 
 
301 aa  265  1e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.877209  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0057  general glycosylation pathway protein  39.46 
 
 
307 aa  168  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3768  hypothetical protein  31.44 
 
 
320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3950  hypothetical protein  31.44 
 
 
320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3824  hypothetical protein  31.44 
 
 
320 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3768  hypothetical protein  31.97 
 
 
315 aa  119  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0500  hypothetical protein  30.95 
 
 
320 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3489  hypothetical protein  30.19 
 
 
317 aa  116  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0540  hypothetical protein  30.19 
 
 
320 aa  115  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0541  hypothetical protein  30.19 
 
 
320 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3535  hypothetical protein  33.59 
 
 
325 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0651  hypothetical protein  30.98 
 
 
329 aa  113  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0771  hypothetical protein  29.73 
 
 
287 aa  76.3  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1457  hypothetical protein  27.49 
 
 
292 aa  63.5  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33460  general glycosylation protein  37.04 
 
 
90 aa  56.2  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0191  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.1 
 
 
498 aa  51.6  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.332508  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0052  putative methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  31.96 
 
 
516 aa  50.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2483  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31 
 
 
464 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.132022 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1307  methyl-accepting chemotaxis protein  47.22 
 
 
596 aa  48.9  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917497  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2759  hypothetical protein  33.72 
 
 
155 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.474468  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0289  methyl-accepting chemotaxis protein  26.72 
 
 
665 aa  48.1  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.67 
 
 
690 aa  47  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0556  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.67 
 
 
690 aa  47  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3301  pyruvate carboxyltransferase  25.47 
 
 
609 aa  46.2  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.709105 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0770  diguanylate phosphodiesterase  36.46 
 
 
414 aa  45.4  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.294803  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0190  methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 
657 aa  44.3  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.145639  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0166  hypothetical protein  38.18 
 
 
145 aa  43.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.604239 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.88 
 
 
606 aa  43.1  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000541258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>