24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_33460 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_33460  general glycosylation protein  100 
 
 		 90 aa  177  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1936  hypothetical protein  54.44 
 
 		 155 aa  103  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.191079  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2759  hypothetical protein  40 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.474468  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2035  hypothetical protein  54.32 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.876573  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0057  general glycosylation pathway protein  40.74 
 
 		 307 aa  61.6  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0651  hypothetical protein  35.56 
 
 		 329 aa  61.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3535  hypothetical protein  39.51 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3768  hypothetical protein  40.74 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0500  hypothetical protein  38.27 
 
 		 320 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3768  hypothetical protein  38.27 
 
 		 320 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3950  hypothetical protein  38.27 
 
 		 320 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3824  hypothetical protein  38.27 
 
 		 320 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0540  hypothetical protein  38.27 
 
 		 320 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3489  hypothetical protein  38.27 
 
 		 317 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0541  hypothetical protein  38.27 
 
 		 320 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1675  hypothetical protein  30.23 
 
 		 301 aa  52.4  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.877209  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1766  general glycosylation pathway protein  31.87 
 
 		 301 aa  46.6  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1353  general glycosylation pathway protein  30.11 
 
 		 301 aa  43.9  0.0007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0948  general glycosylation pathway protein  37.04 
 
 		 299 aa  43.5  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.269754  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1137  general glycosylation pathway protein  33.33 
 
 		 297 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0446  hypothetical protein  29.63 
 
 		 298 aa  41.2  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0602  general glycosylation pathway protein  31.82 
 
 		 297 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1262  general glycosylation pathway protein  31.82 
 
 		 297 aa  40.8  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2932  hypothetical protein  30.43 
 
 		 163 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000232307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>