36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0446 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0446  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  603  9.999999999999999e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1201  general glycosylation pathway protein  82.77 
 
 		 297 aa  507  1e-143  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1353  general glycosylation pathway protein  65.88 
 
 		 301 aa  404  1.0000000000000001e-112  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1766  general glycosylation pathway protein  53.33 
 
 		 301 aa  328  6e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0948  general glycosylation pathway protein  58.5 
 
 		 299 aa  326  3e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.269754  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1262  general glycosylation pathway protein  57.58 
 
 		 297 aa  316  3e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0602  general glycosylation pathway protein  57.58 
 
 		 297 aa  315  5e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1137  general glycosylation pathway protein  56.9 
 
 		 297 aa  311  1e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1675  hypothetical protein  47.6 
 
 		 301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.877209  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0057  general glycosylation pathway protein  39.13 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3768  hypothetical protein  31.4 
 
 		 320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3950  hypothetical protein  31.4 
 
 		 320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3824  hypothetical protein  31.4 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0500  hypothetical protein  31.4 
 
 		 320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3489  hypothetical protein  32.23 
 
 		 317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0541  hypothetical protein  30.99 
 
 		 320 aa  119  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0540  hypothetical protein  31.82 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0651  hypothetical protein  32.27 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3535  hypothetical protein  32.24 
 
 		 325 aa  112  9e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3768  hypothetical protein  30.65 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0771  hypothetical protein  31.56 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1457  hypothetical protein  28.05 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3301  pyruvate carboxyltransferase  30.3 
 
 		 609 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.709105 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0556  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.15 
 
 		 690 aa  48.5  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.15 
 
 		 690 aa  48.5  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0520  HMGL-like domain-containing protein  29.35 
 
 		 604 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.999411  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0365  accessory colonization factor AcfB  32.05 
 
 		 626 aa  46.2  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  30.19 
 
 		 626 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0993  diguanylate phosphodiesterase  29.13 
 
 		 441 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0988  methyl-accepting chemotaxis protein  28.57 
 
 		 695 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.49 
 
 		 628 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  30.49 
 
 		 643 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.77 
 
 		 698 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000832175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  27.59 
 
 		 1130 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.04 
 
 		 628 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1307  methyl-accepting chemotaxis protein  35.06 
 
 		 596 aa  43.1  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>