17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0419 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0419  CBS domain containing protein  100 
 
 		 420 aa  837    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.092236  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1388  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.81 
 
 		 806 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844108  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2483  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.03 
 
 		 464 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.132022 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3768  hypothetical protein  31.82 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1033  diguanylate phosphodiesterase  30 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0057  general glycosylation pathway protein  35.29 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3535  hypothetical protein  39.13 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0651  hypothetical protein  39.74 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0540  hypothetical protein  37.04 
 
 		 320 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3824  hypothetical protein  37.35 
 
 		 320 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3950  hypothetical protein  37.35 
 
 		 320 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3489  hypothetical protein  37.04 
 
 		 317 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3768  hypothetical protein  37.35 
 
 		 320 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0500  hypothetical protein  37.35 
 
 		 320 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0541  hypothetical protein  37.04 
 
 		 320 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0993  diguanylate phosphodiesterase  29.35 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0191  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.27 
 
 		 498 aa  43.1  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.332508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>