More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3598 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3598  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 113 aa  221  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  52.68 
 
 		 112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  54.87 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  110  7.000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  110  9e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.89 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2861  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.715878  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  50.89 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  50.89 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.89 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.89 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.89 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.89 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.89 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.89 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.89 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.89 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.89 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.89 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.89 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  46.43 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  105  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  48.21 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  49.11 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  47.32 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  48.21 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  47.32 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  47.32 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  47.32 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  47.32 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  104  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0104  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  104  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2479  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494885  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4445  nitrogen regulatory protein P-II, GlnB, GlnK  43.75 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1020  nitrogen regulatory protein P-II  46.9 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.852949  normal  0.847893 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  102  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  47.32 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  48.21 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  46.43 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2231  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000261063 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2491  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0578365  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1489  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  45.54 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  47.32 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  100  9e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  46.9 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2863  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00920081  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0141  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457658  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  99.4  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  98.6  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  46.43 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  46.15 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  98.2  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  98.2  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>