58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1131 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1131  curli production assembly/transport component CsgG subfamily protein  100 
 
 		 222 aa  443  1.0000000000000001e-124  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00305065  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0880  outer membrane lipoprotein  77.93 
 
 		 224 aa  358  5e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1493  outer membrane lipoprotein  69.95 
 
 		 219 aa  305  4.0000000000000004e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0503324  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1449  curli production assembly/transport component CsgG  65.45 
 
 		 223 aa  302  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1337  curli production assembly/transport component CsgG  65.45 
 
 		 223 aa  302  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.919367  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1390  curli production assembly/transport component CsgG  65.45 
 
 		 223 aa  302  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2723  curli production assembly/transport component CsgG  65.45 
 
 		 244 aa  301  4.0000000000000003e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4012  Curli production assembly/transport component CsgG  64.55 
 
 		 223 aa  301  5.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4279  Curli production assembly/transport component CsgG  64.55 
 
 		 223 aa  295  5e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4221  Curli production assembly/transport component CsgG  64.49 
 
 		 223 aa  294  9e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4600  Curli production assembly/transport component CsgG  64.09 
 
 		 223 aa  293  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1250  CsgG family protein  60.62 
 
 		 227 aa  280  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5407  curli production assembly/transport component CsgG  61.79 
 
 		 226 aa  279  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2759  Curli production assembly/transport component CsgG  62.16 
 
 		 226 aa  278  5e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2999  curli production assembly/transport component CsgG  63.24 
 
 		 225 aa  277  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0109  CsgG family protein  61.47 
 
 		 225 aa  275  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136515  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1651  putative curli production assembly/transport component CsgG  61.47 
 
 		 301 aa  274  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3082  putative curli production assembly/transport component CsgG  61.47 
 
 		 301 aa  274  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.601979  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2914  curli production assembly/transport component CsgG  63.05 
 
 		 225 aa  274  8e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3467  putative curli production assembly/transport component CsgG  61.47 
 
 		 301 aa  274  8e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3889  csgG family protein  61.47 
 
 		 225 aa  274  9e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.816763  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3970  csgG family protein  61.47 
 
 		 225 aa  274  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3005  curli production assembly/transport component CsgG  62.56 
 
 		 253 aa  274  9e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2391  twin-arginine translocation pathway signal  62.56 
 
 		 253 aa  274  9e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3024  curli production assembly/transport component CsgG  61.58 
 
 		 225 aa  272  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1457  curli production assembly/transport component CsgG  64.53 
 
 		 225 aa  272  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3562  curli production assembly/transport component CsgG  60.98 
 
 		 224 aa  270  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167044  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00570  putative lipoprotein  59.36 
 
 		 228 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27192  normal  0.120076 
 
 
-
 
NC_003296  RS01776  lipoprotein  61.95 
 
 		 227 aa  268  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00673998  normal  0.858527 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2891  curli production assembly/transport component CsgG, putative  62.07 
 
 		 207 aa  268  7e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5339  CsgG family protein  59.53 
 
 		 224 aa  266  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3206  curli production assembly/transport component CsgG, putative  61.58 
 
 		 207 aa  266  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0048  putative lipoprotein  61.19 
 
 		 228 aa  262  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0420  Curli production assembly/transport component CsgG  35.93 
 
 		 321 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0419  Curli production assembly/transport component CsgG  39.33 
 
 		 321 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0391  curli production assembly/transport component CsgG  39.33 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1763  putative curli production assembly/transport component CsgG  31.39 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281584  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4121  curli production assembly/transport component CsgG  35 
 
 		 323 aa  121  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05526  hypothetical protein  35.09 
 
 		 322 aa  121  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4674  curli production assembly/transport component CsgG  34.83 
 
 		 337 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.501006  normal  0.0721593 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3786  hypothetical protein  28.7 
 
 		 321 aa  105  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0180472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3425  putative lipoprotein  54.95 
 
 		 100 aa  93.6  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1195  hypothetical protein  26.82 
 
 		 315 aa  65.1  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00195714  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1286  Curli production assembly/transport component CsgG  28.8 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.47736  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1695  hypothetical protein  31.45 
 
 		 332 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15901  hypothetical protein  29.71 
 
 		 275 aa  48.5  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3644  curli production assembly/transport component CsgG  28.38 
 
 		 340 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1105  Curli production assembly/transport component CsgG  26.5 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000129155  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1155  curli production assembly/transport subunit CsgG  22.64 
 
 		 277 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1518  Curli production assembly/transport component CsgG  27.91 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000284024  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1717  curli production assembly/transport component CsgG  27.17 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000937383  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2096  curli production assembly/transport subunit CsgG  22.26 
 
 		 277 aa  43.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2562  curli production assembly/transport component CsgG  22.26 
 
 		 277 aa  43.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.25398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1156  curli production assembly/transport subunit CsgG  22.26 
 
 		 277 aa  43.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01041  hypothetical protein  22.26 
 
 		 277 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.756314  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2608  Curli production assembly/transport component CsgG  22.26 
 
 		 277 aa  43.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0251589  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01034  outer membrane lipoprotein  22.26 
 
 		 277 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.743614  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1416  curli production assembly/transport subunit CsgG  22.26 
 
 		 277 aa  42.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0591449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>