55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3024 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_3024  curli production assembly/transport component CsgG  100 
 
 		 225 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2999  curli production assembly/transport component CsgG  95.56 
 
 		 225 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3005  curli production assembly/transport component CsgG  97.78 
 
 		 253 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2391  twin-arginine translocation pathway signal  97.78 
 
 		 253 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2914  curli production assembly/transport component CsgG  96.89 
 
 		 225 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3970  csgG family protein  82.22 
 
 		 225 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3082  putative curli production assembly/transport component CsgG  81.86 
 
 		 301 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.601979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3889  csgG family protein  82.22 
 
 		 225 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.816763  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1651  putative curli production assembly/transport component CsgG  81.86 
 
 		 301 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3467  putative curli production assembly/transport component CsgG  81.86 
 
 		 301 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0109  CsgG family protein  81.78 
 
 		 225 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136515  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3206  curli production assembly/transport component CsgG, putative  85.99 
 
 		 207 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2891  curli production assembly/transport component CsgG, putative  85.51 
 
 		 207 aa  374  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1457  curli production assembly/transport component CsgG  74.27 
 
 		 225 aa  318  3.9999999999999996e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00570  putative lipoprotein  72.3 
 
 		 228 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27192  normal  0.120076 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1390  curli production assembly/transport component CsgG  68.98 
 
 		 223 aa  314  6e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1250  CsgG family protein  69.44 
 
 		 227 aa  307  9e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0048  putative lipoprotein  73.63 
 
 		 228 aa  305  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5339  CsgG family protein  68.02 
 
 		 224 aa  305  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4012  Curli production assembly/transport component CsgG  65.91 
 
 		 223 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4600  Curli production assembly/transport component CsgG  66.36 
 
 		 223 aa  301  5.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4279  Curli production assembly/transport component CsgG  66.36 
 
 		 223 aa  301  5.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1449  curli production assembly/transport component CsgG  66.22 
 
 		 223 aa  301  6.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1337  curli production assembly/transport component CsgG  66.22 
 
 		 223 aa  301  6.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.919367  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2723  curli production assembly/transport component CsgG  66.22 
 
 		 244 aa  300  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3562  curli production assembly/transport component CsgG  68.2 
 
 		 224 aa  298  4e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5407  curli production assembly/transport component CsgG  68.06 
 
 		 226 aa  296  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01776  lipoprotein  68.14 
 
 		 227 aa  295  4e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00673998  normal  0.858527 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4221  Curli production assembly/transport component CsgG  63.64 
 
 		 223 aa  293  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0880  outer membrane lipoprotein  64.79 
 
 		 224 aa  290  1e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1493  outer membrane lipoprotein  63.26 
 
 		 219 aa  280  1e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0503324  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2759  Curli production assembly/transport component CsgG  61.06 
 
 		 226 aa  280  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1131  curli production assembly/transport component CsgG subfamily protein  61.79 
 
 		 222 aa  278  4e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00305065  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1763  putative curli production assembly/transport component CsgG  34.38 
 
 		 324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281584  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4121  curli production assembly/transport component CsgG  39.05 
 
 		 323 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0420  Curli production assembly/transport component CsgG  39.77 
 
 		 321 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0419  Curli production assembly/transport component CsgG  39.77 
 
 		 321 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0391  curli production assembly/transport component CsgG  40.96 
 
 		 320 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4674  curli production assembly/transport component CsgG  35.15 
 
 		 337 aa  98.6  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.501006  normal  0.0721593 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3425  putative lipoprotein  50.51 
 
 		 100 aa  94.7  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3786  hypothetical protein  31.44 
 
 		 321 aa  94.7  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0180472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05526  hypothetical protein  32.89 
 
 		 322 aa  92.4  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1195  hypothetical protein  28.05 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00195714  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1695  hypothetical protein  27.33 
 
 		 332 aa  55.1  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1286  Curli production assembly/transport component CsgG  27.88 
 
 		 260 aa  52.8  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.47736  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1457  CsgG family protein, putative  28.8 
 
 		 330 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3644  curli production assembly/transport component CsgG  30.92 
 
 		 340 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1155  curli production assembly/transport subunit CsgG  25.2 
 
 		 277 aa  42.4  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1553  curli production assembly/transport component CsgG  23.81 
 
 		 277 aa  42  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.301914  normal  0.209181 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2096  curli production assembly/transport subunit CsgG  24.3 
 
 		 277 aa  41.6  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2562  curli production assembly/transport component CsgG  24.3 
 
 		 277 aa  41.6  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.25398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1156  curli production assembly/transport subunit CsgG  24.3 
 
 		 277 aa  41.6  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01041  hypothetical protein  24.3 
 
 		 277 aa  41.6  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.756314  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2608  Curli production assembly/transport component CsgG  24.3 
 
 		 277 aa  41.6  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0251589  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01034  outer membrane lipoprotein  24.3 
 
 		 277 aa  41.6  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.743614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>