69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1695 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1695  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  648    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3644  curli production assembly/transport component CsgG  57.36 
 
 		 340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1457  CsgG family protein, putative  45.58 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2162  curli production assembly/transport component CsgG  33.76 
 
 		 327 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1195  hypothetical protein  27.72 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00195714  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0374  Curli production assembly/transport component CsgG  27.24 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3786  hypothetical protein  28.06 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0180472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1501  hypothetical protein  34.65 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129872 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1518  Curli production assembly/transport component CsgG  31.78 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000284024  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1717  curli production assembly/transport component CsgG  29.71 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000937383  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1105  Curli production assembly/transport component CsgG  28.99 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000129155  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4674  curli production assembly/transport component CsgG  28.06 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.501006  normal  0.0721593 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15901  hypothetical protein  35.88 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0323  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00135307  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0419  Curli production assembly/transport component CsgG  26.83 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0420  Curli production assembly/transport component CsgG  27.18 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690548  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2999  curli production assembly/transport component CsgG  27.33 
 
 		 225 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2391  twin-arginine translocation pathway signal  27.33 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3005  curli production assembly/transport component CsgG  27.33 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2914  curli production assembly/transport component CsgG  27.33 
 
 		 225 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3024  curli production assembly/transport component CsgG  27.33 
 
 		 225 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4121  curli production assembly/transport component CsgG  25.69 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0391  curli production assembly/transport component CsgG  25.78 
 
 		 320 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1763  putative curli production assembly/transport component CsgG  23.99 
 
 		 324 aa  53.1  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281584  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5339  CsgG family protein  28.95 
 
 		 224 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0651  hypothetical protein  29.2 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1131  curli production assembly/transport component CsgG subfamily protein  31.45 
 
 		 222 aa  50.8  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00305065  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2475  hypothetical protein  33.98 
 
 		 312 aa  50.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000341463  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1250  CsgG family protein  22.59 
 
 		 227 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0109  CsgG family protein  25.49 
 
 		 225 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136515  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2723  curli production assembly/transport component CsgG  28.8 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3467  putative curli production assembly/transport component CsgG  25.49 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2759  Curli production assembly/transport component CsgG  24.26 
 
 		 226 aa  48.9  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1457  curli production assembly/transport component CsgG  25.51 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3082  putative curli production assembly/transport component CsgG  25.49 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.601979  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3970  csgG family protein  25.49 
 
 		 225 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3889  csgG family protein  25.49 
 
 		 225 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.816763  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1651  putative curli production assembly/transport component CsgG  25.49 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2891  curli production assembly/transport component CsgG, putative  25.49 
 
 		 207 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3206  curli production assembly/transport component CsgG, putative  25.49 
 
 		 207 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0048  putative lipoprotein  26.98 
 
 		 228 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1337  curli production assembly/transport component CsgG  26.61 
 
 		 223 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.919367  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1493  outer membrane lipoprotein  25.49 
 
 		 219 aa  48.5  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0503324  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1449  curli production assembly/transport component CsgG  26.61 
 
 		 223 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00570  putative lipoprotein  27.37 
 
 		 228 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27192  normal  0.120076 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0637  hypothetical protein  26.61 
 
 		 201 aa  47  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0353203  normal  0.98697 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05526  hypothetical protein  25.39 
 
 		 322 aa  47  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2914  hypothetical protein  25.69 
 
 		 201 aa  46.2  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000421511  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3243  hypothetical protein  24.77 
 
 		 201 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126868  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0914  hypothetical protein  25.69 
 
 		 201 aa  45.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.310752  normal  0.0133601 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3562  curli production assembly/transport component CsgG  26.85 
 
 		 224 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167044  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0935  hypothetical protein  24.77 
 
 		 201 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000406943  normal  0.0868767 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0884  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.77 
 
 		 201 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000370182  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3403  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.77 
 
 		 197 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00726225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0086  periplasmic protein  25.17 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0898  hypothetical protein  24.77 
 
 		 201 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000138757  normal  0.418189 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3015  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.77 
 
 		 201 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3478  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.77 
 
 		 201 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0966746  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0964  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.77 
 
 		 197 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0219897  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1060  hypothetical protein  24.77 
 
 		 197 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3601  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.77 
 
 		 201 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3039  hypothetical protein  24.77 
 
 		 201 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000888459  normal  0.414715 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0824  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.69 
 
 		 201 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.525373  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01776  lipoprotein  27.95 
 
 		 227 aa  44.3  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00673998  normal  0.858527 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1390  curli production assembly/transport component CsgG  25.33 
 
 		 223 aa  43.9  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0322  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 401 aa  43.5  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000024467  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0836  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.77 
 
 		 197 aa  43.5  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0143317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0880  outer membrane lipoprotein  24.66 
 
 		 224 aa  43.1  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3157  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 		 660 aa  42.7  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.381068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>