46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1286 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1286  Curli production assembly/transport component CsgG  100 
 
 		 260 aa  521  1e-147  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.47736  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05526  hypothetical protein  27.96 
 
 		 322 aa  68.9  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5339  CsgG family protein  25.31 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1717  curli production assembly/transport component CsgG  32.12 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000937383  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1105  Curli production assembly/transport component CsgG  31.36 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000129155  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1337  curli production assembly/transport component CsgG  27.42 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.919367  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1449  curli production assembly/transport component CsgG  27.42 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4279  Curli production assembly/transport component CsgG  24.79 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2723  curli production assembly/transport component CsgG  27.02 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00570  putative lipoprotein  24.58 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27192  normal  0.120076 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4221  Curli production assembly/transport component CsgG  24.68 
 
 		 223 aa  62  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1131  curli production assembly/transport component CsgG subfamily protein  28.09 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00305065  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4600  Curli production assembly/transport component CsgG  24.36 
 
 		 223 aa  62  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3562  curli production assembly/transport component CsgG  25.41 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167044  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1518  Curli production assembly/transport component CsgG  31.85 
 
 		 209 aa  62  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000284024  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01776  lipoprotein  25.21 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00673998  normal  0.858527 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4012  Curli production assembly/transport component CsgG  25.42 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3024  curli production assembly/transport component CsgG  28.48 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0109  CsgG family protein  28.3 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136515  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2999  curli production assembly/transport component CsgG  27.27 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3082  putative curli production assembly/transport component CsgG  28.3 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.601979  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3970  csgG family protein  28.3 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3889  csgG family protein  28.3 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.816763  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1651  putative curli production assembly/transport component CsgG  28.3 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3467  putative curli production assembly/transport component CsgG  28.3 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3005  curli production assembly/transport component CsgG  26.95 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2391  twin-arginine translocation pathway signal  26.95 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3206  curli production assembly/transport component CsgG, putative  28.3 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2891  curli production assembly/transport component CsgG, putative  28.3 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1457  curli production assembly/transport component CsgG  28.39 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2914  curli production assembly/transport component CsgG  27.27 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1390  curli production assembly/transport component CsgG  23.93 
 
 		 223 aa  57  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0048  putative lipoprotein  23.61 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5407  curli production assembly/transport component CsgG  25.33 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3786  hypothetical protein  29.7 
 
 		 321 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0180472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2759  Curli production assembly/transport component CsgG  27.56 
 
 		 226 aa  53.9  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4674  curli production assembly/transport component CsgG  27.73 
 
 		 337 aa  52.8  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.501006  normal  0.0721593 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1250  CsgG family protein  24.68 
 
 		 227 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1493  outer membrane lipoprotein  25.86 
 
 		 219 aa  49.3  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0503324  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0420  Curli production assembly/transport component CsgG  34.38 
 
 		 321 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690548  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0880  outer membrane lipoprotein  24.89 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15901  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0374  Curli production assembly/transport component CsgG  31.09 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0419  Curli production assembly/transport component CsgG  35.42 
 
 		 321 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0391  curli production assembly/transport component CsgG  34.38 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1195  hypothetical protein  24.04 
 
 		 315 aa  46.2  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00195714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>