36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3425 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3425  putative lipoprotein  100 
 
 		 100 aa  208  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2759  Curli production assembly/transport component CsgG  93.94 
 
 		 226 aa  194  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5407  curli production assembly/transport component CsgG  71.43 
 
 		 226 aa  139  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4012  Curli production assembly/transport component CsgG  60.61 
 
 		 223 aa  114  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4279  Curli production assembly/transport component CsgG  58.59 
 
 		 223 aa  111  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4221  Curli production assembly/transport component CsgG  58.59 
 
 		 223 aa  111  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4600  Curli production assembly/transport component CsgG  57.58 
 
 		 223 aa  110  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1390  curli production assembly/transport component CsgG  59.34 
 
 		 223 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00570  putative lipoprotein  60.49 
 
 		 228 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27192  normal  0.120076 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1457  curli production assembly/transport component CsgG  60 
 
 		 225 aa  99  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1250  CsgG family protein  53.49 
 
 		 227 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3562  curli production assembly/transport component CsgG  56.25 
 
 		 224 aa  97.4  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167044  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5339  CsgG family protein  55.17 
 
 		 224 aa  97.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01776  lipoprotein  56.1 
 
 		 227 aa  97.1  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00673998  normal  0.858527 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2723  curli production assembly/transport component CsgG  60.53 
 
 		 244 aa  96.7  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1449  curli production assembly/transport component CsgG  60.53 
 
 		 223 aa  96.7  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1337  curli production assembly/transport component CsgG  60.53 
 
 		 223 aa  96.7  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.919367  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0880  outer membrane lipoprotein  58.54 
 
 		 224 aa  95.1  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1131  curli production assembly/transport component CsgG subfamily protein  54.95 
 
 		 222 aa  93.6  9e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00305065  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0048  putative lipoprotein  64.18 
 
 		 228 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2999  curli production assembly/transport component CsgG  55 
 
 		 225 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2914  curli production assembly/transport component CsgG  51.65 
 
 		 225 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3024  curli production assembly/transport component CsgG  50.51 
 
 		 225 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2391  twin-arginine translocation pathway signal  55 
 
 		 253 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3005  curli production assembly/transport component CsgG  55 
 
 		 253 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1493  outer membrane lipoprotein  49.38 
 
 		 219 aa  88.2  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0503324  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3082  putative curli production assembly/transport component CsgG  53.49 
 
 		 301 aa  85.9  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.601979  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3467  putative curli production assembly/transport component CsgG  53.49 
 
 		 301 aa  85.9  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1651  putative curli production assembly/transport component CsgG  53.49 
 
 		 301 aa  85.9  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3889  csgG family protein  57.47 
 
 		 225 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.816763  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3970  csgG family protein  57.47 
 
 		 225 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2891  curli production assembly/transport component CsgG, putative  53.75 
 
 		 207 aa  84.7  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3206  curli production assembly/transport component CsgG, putative  52.5 
 
 		 207 aa  84  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0109  CsgG family protein  56.32 
 
 		 225 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136515  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4121  curli production assembly/transport component CsgG  30 
 
 		 323 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1763  putative curli production assembly/transport component CsgG  28.89 
 
 		 324 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>